162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4099 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  50.06 
 
 
799 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  50.8 
 
 
798 aa  682    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  51.42 
 
 
798 aa  684    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  90.63 
 
 
779 aa  1454    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  100 
 
 
779 aa  1587    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  43.06 
 
 
872 aa  562  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  40.51 
 
 
708 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  36.69 
 
 
647 aa  355  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  32.19 
 
 
698 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  31.69 
 
 
620 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  31.39 
 
 
706 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  28.23 
 
 
1094 aa  238  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  28.85 
 
 
840 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  30.9 
 
 
631 aa  227  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  28.46 
 
 
661 aa  220  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  31.05 
 
 
625 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  31.11 
 
 
647 aa  208  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  26.5 
 
 
687 aa  205  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  29.54 
 
 
625 aa  189  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  29.28 
 
 
677 aa  188  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  30.55 
 
 
676 aa  183  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  30.98 
 
 
628 aa  183  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  29.76 
 
 
523 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  27.12 
 
 
734 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  28.84 
 
 
643 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  41.25 
 
 
536 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  27.17 
 
 
528 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  37.04 
 
 
515 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  27.33 
 
 
679 aa  122  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  34.71 
 
 
508 aa  122  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  28.14 
 
 
512 aa  120  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  26.21 
 
 
536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  33.62 
 
 
502 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  33.62 
 
 
502 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  33.62 
 
 
486 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  34.04 
 
 
487 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  25.76 
 
 
1272 aa  107  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  25.21 
 
 
1380 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  26.39 
 
 
569 aa  103  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  33.62 
 
 
527 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  26.38 
 
 
496 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  25.92 
 
 
1363 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  25.78 
 
 
1363 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  31.84 
 
 
490 aa  99.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  30.35 
 
 
519 aa  98.2  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  31.86 
 
 
532 aa  97.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  27.12 
 
 
516 aa  95.9  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  31.17 
 
 
570 aa  94.7  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  31.06 
 
 
542 aa  94.7  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  25.72 
 
 
551 aa  94  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  25.48 
 
 
1201 aa  92  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  27.61 
 
 
534 aa  92.4  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  26.65 
 
 
534 aa  91.3  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  27.1 
 
 
1973 aa  90.5  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  32.4 
 
 
470 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  25.57 
 
 
524 aa  89.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  32.4 
 
 
470 aa  89.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  32.4 
 
 
470 aa  89.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.246662 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  29.66 
 
 
528 aa  89  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3425  repressor protein for FtsI  32.02 
 
 
470 aa  89  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  32.4 
 
 
470 aa  89.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  24.89 
 
 
533 aa  89  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  32.4 
 
 
470 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  32.02 
 
 
505 aa  89.4  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  24.95 
 
 
877 aa  88.2  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  29.23 
 
 
551 aa  87.8  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  29.52 
 
 
533 aa  87.8  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  28.82 
 
 
539 aa  87.4  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 
470 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  29.52 
 
 
533 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 
470 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 
470 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  33.33 
 
 
499 aa  87  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 
470 aa  87  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 
470 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  31.84 
 
 
470 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  25.97 
 
 
556 aa  86.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 
470 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  29.52 
 
 
533 aa  86.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 
470 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0583  repressor protein for FtsI  32.96 
 
 
474 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  32.96 
 
 
474 aa  85.5  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0665  repressor protein for FtsI  32.96 
 
 
474 aa  85.5  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  25.2 
 
 
1430 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  33.52 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  29.14 
 
 
645 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3767  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 
470 aa  84.7  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3609  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 
470 aa  84.3  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0334  repressor protein for FtsI  31.84 
 
 
471 aa  84  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  27.3 
 
 
1601 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0341  repressor protein for FtsI  32.4 
 
 
471 aa  83.2  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  30.3 
 
 
506 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  27.78 
 
 
536 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  27.78 
 
 
536 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  27.78 
 
 
536 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  27.78 
 
 
536 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  27.78 
 
 
536 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  25.46 
 
 
547 aa  80.5  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0069  Bilirubin oxidase  27.16 
 
 
603 aa  80.5  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  26.64 
 
 
760 aa  80.1  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>