132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1486 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  63.68 
 
 
1303 aa  1580    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  45.98 
 
 
1201 aa  718    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  44.76 
 
 
1299 aa  825    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  49.73 
 
 
1380 aa  939    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  38.69 
 
 
1248 aa  644    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  46.98 
 
 
1430 aa  859    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  39.09 
 
 
1247 aa  658    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  100 
 
 
1601 aa  3237    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  49.91 
 
 
1363 aa  936    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  43.61 
 
 
1299 aa  821    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  54.48 
 
 
1736 aa  1056    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  46.33 
 
 
1272 aa  851    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  49.5 
 
 
1363 aa  930    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  53.71 
 
 
1308 aa  534  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  38.79 
 
 
1973 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  31.25 
 
 
734 aa  220  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  27.91 
 
 
2656 aa  108  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  31.23 
 
 
625 aa  99.8  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  35.44 
 
 
798 aa  92  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  36.17 
 
 
620 aa  90.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  33.98 
 
 
799 aa  90.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  38.19 
 
 
1152 aa  90.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  33.67 
 
 
647 aa  85.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  50.98 
 
 
1474 aa  85.9  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  53.19 
 
 
1247 aa  85.9  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  48.6 
 
 
1585 aa  85.5  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  52.69 
 
 
1002 aa  84.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  52.13 
 
 
1217 aa  84.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  35.51 
 
 
1406 aa  84.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  33.33 
 
 
798 aa  83.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  27.3 
 
 
779 aa  83.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  26.95 
 
 
779 aa  82  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  28.66 
 
 
698 aa  81.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  35.42 
 
 
708 aa  80.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  30.18 
 
 
631 aa  80.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  29.02 
 
 
523 aa  77.8  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  33.51 
 
 
661 aa  78.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  28.31 
 
 
675 aa  77.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.91 
 
 
984 aa  75.5  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  30.79 
 
 
482 aa  75.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  29.33 
 
 
647 aa  74.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  27.68 
 
 
625 aa  74.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  33 
 
 
703 aa  73.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  34.87 
 
 
1275 aa  73.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  29.81 
 
 
1127 aa  72.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  29.31 
 
 
687 aa  72.4  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  36.84 
 
 
1141 aa  72.8  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  41.73 
 
 
1295 aa  71.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.7 
 
 
915 aa  71.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  41.59 
 
 
1414 aa  71.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  40.4 
 
 
1132 aa  70.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  46.15 
 
 
1362 aa  70.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  31.11 
 
 
1047 aa  69.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2547  triple tyrosine motif-containing protein  19.91 
 
 
686 aa  69.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  28.57 
 
 
1127 aa  68.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  24.66 
 
 
872 aa  68.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  29.27 
 
 
840 aa  68.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2250  triple tyrosine motif-containing protein  18.54 
 
 
681 aa  68.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  26.42 
 
 
1094 aa  67.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  33.33 
 
 
677 aa  67.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  29.41 
 
 
1219 aa  66.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  26.61 
 
 
706 aa  66.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  40 
 
 
767 aa  66.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  33.72 
 
 
1059 aa  66.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  35.25 
 
 
536 aa  65.9  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  34.63 
 
 
1054 aa  65.9  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  38.02 
 
 
846 aa  63.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 
1127 aa  63.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  28.1 
 
 
676 aa  63.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  37.12 
 
 
1051 aa  63.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  53.85 
 
 
1302 aa  63.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  27.78 
 
 
499 aa  62  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 
1127 aa  62  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  39.09 
 
 
1053 aa  61.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  42.48 
 
 
974 aa  60.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  27.24 
 
 
3507 aa  60.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  33.61 
 
 
643 aa  60.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  35.94 
 
 
1452 aa  60.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  40.37 
 
 
340 aa  59.3  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  33.96 
 
 
343 aa  58.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  40.19 
 
 
991 aa  58.9  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  34.55 
 
 
692 aa  58.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  32.87 
 
 
1123 aa  58.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  31.54 
 
 
1129 aa  58.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  31.82 
 
 
1096 aa  58.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  42.22 
 
 
1223 aa  57.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  35.14 
 
 
778 aa  57.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 
966 aa  57.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  31.3 
 
 
962 aa  57.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44 
 
 
979 aa  57.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  31.87 
 
 
1146 aa  57  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  30.53 
 
 
1224 aa  56.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  35.51 
 
 
846 aa  56.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  30.56 
 
 
515 aa  55.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  39.2 
 
 
963 aa  55.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  29 
 
 
1444 aa  55.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0815  hypothetical protein  24.62 
 
 
1124 aa  54.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.676426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  31.21 
 
 
528 aa  54.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  31.62 
 
 
506 aa  53.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  39.47 
 
 
995 aa  53.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>