68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05607 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  100 
 
 
962 aa  1978    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  30.57 
 
 
846 aa  171  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  29.78 
 
 
846 aa  168  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  29.15 
 
 
846 aa  168  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  28.6 
 
 
848 aa  160  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  31.94 
 
 
1204 aa  134  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0591  putative chitinase  31.1 
 
 
306 aa  129  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  25.3 
 
 
1152 aa  104  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  27.94 
 
 
1406 aa  79.7  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  28.57 
 
 
1123 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  25.53 
 
 
1127 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  21.98 
 
 
1054 aa  73.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  20.63 
 
 
1051 aa  73.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  25.97 
 
 
1285 aa  70.1  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  25.23 
 
 
1127 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  28.74 
 
 
1362 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  25.99 
 
 
1096 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  21.89 
 
 
1053 aa  68.2  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  31.82 
 
 
792 aa  67  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  25.47 
 
 
1219 aa  66.6  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  36.03 
 
 
1585 aa  65.1  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  26.42 
 
 
1127 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  42.11 
 
 
1217 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  27.84 
 
 
1127 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  27.96 
 
 
1224 aa  63.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  43.82 
 
 
1002 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  41.57 
 
 
1474 aa  61.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  40.43 
 
 
1247 aa  61.6  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  28.57 
 
 
1141 aa  61.2  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  31.29 
 
 
14944 aa  60.1  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  46.88 
 
 
543 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  22.05 
 
 
703 aa  60.1  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  34.88 
 
 
1132 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 
1129 aa  58.9  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  37.08 
 
 
1275 aa  58.9  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  27.52 
 
 
1457 aa  58.2  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  31.3 
 
 
1601 aa  57.4  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  25.13 
 
 
482 aa  57  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  34.45 
 
 
974 aa  55.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  32.12 
 
 
565 aa  55.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 
727 aa  55.1  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  27.64 
 
 
1047 aa  54.7  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  25.13 
 
 
675 aa  54.3  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  23.74 
 
 
1059 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  23.03 
 
 
820 aa  52.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  27.96 
 
 
499 aa  52.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  24.83 
 
 
1146 aa  51.6  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  37.93 
 
 
1414 aa  51.2  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  36.26 
 
 
1204 aa  51.2  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  27.86 
 
 
699 aa  50.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  29.63 
 
 
827 aa  49.7  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.7 
 
 
587 aa  48.5  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  26.09 
 
 
1444 aa  48.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  27.47 
 
 
972 aa  48.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  22.92 
 
 
805 aa  47.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.56 
 
 
984 aa  47.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.86 
 
 
12684 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  36.05 
 
 
991 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  26.67 
 
 
952 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.95 
 
 
979 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  27.27 
 
 
1452 aa  46.2  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  26.84 
 
 
623 aa  45.8  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  30.34 
 
 
587 aa  45.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  26.82 
 
 
1057 aa  45.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  32.26 
 
 
767 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  30.21 
 
 
892 aa  44.7  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  33.71 
 
 
1752 aa  44.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  21.21 
 
 
831 aa  44.7  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>