80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2223 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  100 
 
 		 343 aa  684    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  49.72 
 
 		 1096 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  45.55 
 
 		 482 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  44.16 
 
 		 1047 aa  136  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  41.41 
 
 		 675 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  40.66 
 
 		 499 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  42.71 
 
 		 1219 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  37.02 
 
 		 1141 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  40 
 
 		 827 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  39.15 
 
 		 1152 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.62 
 
 		 587 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.16 
 
 		 587 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  30.85 
 
 		 606 aa  85.1  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  31.25 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0875  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.57 
 
 		 697 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  35.76 
 
 		 1224 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  37.07 
 
 		 846 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  42.35 
 
 		 1054 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  34.43 
 
 		 1146 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  35.68 
 
 		 846 aa  74.3  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  36.51 
 
 		 848 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1406 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  36.09 
 
 		 846 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  30.46 
 
 		 606 aa  69.3  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  38.07 
 
 		 1127 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  40.46 
 
 		 1051 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  30.88 
 
 		 14944 aa  66.2  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  37.8 
 
 		 1053 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.23 
 
 		 612 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  36.57 
 
 		 1127 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.75 
 
 		 626 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  31.64 
 
 		 1362 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  36.57 
 
 		 1127 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.35 
 
 		 626 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  38.12 
 
 		 1127 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  36.54 
 
 		 1031 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.22 
 
 		 1143 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 		 703 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1452 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  36 
 
 		 1123 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  39.58 
 
 		 991 aa  59.7  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  33.96 
 
 		 1601 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0559  hypothetical protein  41.05 
 
 		 165 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.847441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.89 
 
 		 809 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  36.13 
 
 		 1129 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  51.35 
 
 		 767 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  26.94 
 
 		 1059 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  36.94 
 
 		 663 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  39.13 
 
 		 966 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  31.4 
 
 		 1285 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  31.87 
 
 		 778 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  40.59 
 
 		 692 aa  52.8  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  31.19 
 
 		 744 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  37.61 
 
 		 963 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.48 
 
 		 915 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1449  hypothetical protein  32 
 
 		 820 aa  49.3  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.669353  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1457 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0107  hypothetical protein  36.05 
 
 		 133 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0114248  normal  0.0832153 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  29.11 
 
 		 14609 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4854  peptidase-like  27.83 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.56 
 
 		 3822 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  31.64 
 
 		 743 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  31.15 
 
 		 12684 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.39 
 
 		 6885 aa  46.6  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1090  hypothetical protein  27.15 
 
 		 771 aa  46.6  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  32.98 
 
 		 1132 aa  46.2  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  28.85 
 
 		 3861 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  30.43 
 
 		 952 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  37.68 
 
 		 777 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  32.26 
 
 		 1496 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  30.65 
 
 		 1275 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.43 
 
 		 1448 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  30.22 
 
 		 455 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  27.84 
 
 		 1295 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  39.45 
 
 		 1444 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  30.22 
 
 		 455 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1688  hypothetical protein  35 
 
 		 1035 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  28.63 
 
 		 3562 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  28.65 
 
 		 3824 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1121 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>