18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1688 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1688  hypothetical protein  100 
 
 		 1035 aa  2077    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  32.84 
 
 		 1047 aa  61.6  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  38.75 
 
 		 1141 aa  58.2  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 1219 aa  54.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  42.47 
 
 		 499 aa  53.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  37.89 
 
 		 482 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  31.34 
 
 		 1096 aa  52.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  37.35 
 
 		 1452 aa  51.6  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 491 aa  50.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  36.78 
 
 		 1601 aa  50.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  36.17 
 
 		 663 aa  50.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  28.5 
 
 		 1152 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  37.21 
 
 		 1146 aa  48.9  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  31.39 
 
 		 846 aa  46.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  37.23 
 
 		 767 aa  46.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  32.28 
 
 		 4761 aa  45.8  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  29.6 
 
 		 675 aa  45.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  23.02 
 
 		 1224 aa  44.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>