177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1285 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  960    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  87.63 
 
 
400 aa  596  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  86.1 
 
 
403 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  76.41 
 
 
401 aa  510  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  46.45 
 
 
629 aa  301  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  38.98 
 
 
840 aa  275  9e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  41.85 
 
 
378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  43.79 
 
 
404 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  42.82 
 
 
626 aa  256  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  39.67 
 
 
391 aa  252  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  33.41 
 
 
553 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  33.18 
 
 
559 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  52.21 
 
 
258 aa  203  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  38.76 
 
 
417 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  32.35 
 
 
870 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  35.92 
 
 
408 aa  182  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  34.1 
 
 
1131 aa  179  8e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  32.26 
 
 
528 aa  169  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  30.7 
 
 
481 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  32.21 
 
 
410 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  34.76 
 
 
940 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  52.2 
 
 
200 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  33.04 
 
 
382 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  32.38 
 
 
432 aa  150  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  31.76 
 
 
502 aa  144  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  28.85 
 
 
538 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  31.7 
 
 
938 aa  129  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  28.08 
 
 
436 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  26.96 
 
 
405 aa  120  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  26.17 
 
 
477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  25.44 
 
 
501 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  40.4 
 
 
1047 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  27.98 
 
 
463 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.57 
 
 
769 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  27.51 
 
 
472 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  54.35 
 
 
499 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  30.99 
 
 
2068 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  29.89 
 
 
1287 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  54.84 
 
 
1096 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  52.13 
 
 
482 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  24.17 
 
 
575 aa  96.3  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  52.17 
 
 
1141 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  28.7 
 
 
1219 aa  95.9  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  29.52 
 
 
456 aa  93.2  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  43.7 
 
 
675 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  23.91 
 
 
387 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  28.86 
 
 
485 aa  90.5  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  46.74 
 
 
827 aa  90.1  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  28.41 
 
 
3507 aa  90.1  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  27.4 
 
 
450 aa  87.4  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  28.46 
 
 
439 aa  87  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  23.55 
 
 
708 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.57 
 
 
587 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  48.35 
 
 
606 aa  84.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  28.93 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  31.25 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  46.32 
 
 
663 aa  82.8  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.94 
 
 
587 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.3 
 
 
1272 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  27.66 
 
 
714 aa  82.4  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.18 
 
 
612 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  26.8 
 
 
917 aa  81.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.17 
 
 
2807 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  48.31 
 
 
606 aa  80.5  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  27.91 
 
 
2286 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  34.51 
 
 
938 aa  80.1  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  25.34 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  25.6 
 
 
858 aa  79.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  26.68 
 
 
471 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  27.22 
 
 
4433 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.96 
 
 
626 aa  76.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.22 
 
 
626 aa  76.6  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  25.89 
 
 
696 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  32.98 
 
 
460 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  26.98 
 
 
480 aa  73.6  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  28.57 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0144  hypothetical protein  25.36 
 
 
368 aa  72  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  27.89 
 
 
1862 aa  70.9  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  25.1 
 
 
1848 aa  70.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  24.2 
 
 
669 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  27.42 
 
 
513 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  24.38 
 
 
889 aa  68.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  23.46 
 
 
901 aa  67.4  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  25.95 
 
 
2198 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.71 
 
 
1557 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  41.58 
 
 
1031 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  26.88 
 
 
1933 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  41.3 
 
 
846 aa  63.9  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  39.29 
 
 
1054 aa  63.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  46.34 
 
 
767 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  41.67 
 
 
846 aa  62.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  25.99 
 
 
487 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  36.94 
 
 
744 aa  62.4  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  38.46 
 
 
703 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  41.84 
 
 
1362 aa  60.1  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  23.44 
 
 
688 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  25.07 
 
 
8871 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1755  hypothetical protein  23.86 
 
 
529 aa  58.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  37.63 
 
 
1132 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  42.17 
 
 
1295 aa  57.8  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>