53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0408 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  920    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  32.27 
 
 		 436 aa  173  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  31.96 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  33.67 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  33.72 
 
 		 463 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  31.14 
 
 		 471 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  30.91 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  31.71 
 
 		 480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  29.6 
 
 		 2068 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  31.03 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  26.8 
 
 		 472 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  28.03 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  34.7 
 
 		 3507 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  34.04 
 
 		 4433 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.45 
 
 		 1272 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  27.87 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  27.4 
 
 		 491 aa  96.3  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  27.4 
 
 		 403 aa  96.7  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  29.44 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  26.38 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  24 
 
 		 940 aa  80.1  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  29.78 
 
 		 2286 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  27.7 
 
 		 688 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  22.96 
 
 		 501 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  24.61 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  23.41 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  24.86 
 
 		 2807 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  24.58 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  25.17 
 
 		 938 aa  63.2  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1287 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  29.63 
 
 		 917 aa  60.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  26.4 
 
 		 8871 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  23.41 
 
 		 2198 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1969 aa  56.6  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  25 
 
 		 870 aa  56.6  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  28.43 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  27.27 
 
 		 553 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  23.17 
 
 		 502 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  25.52 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1755  hypothetical protein  21.99 
 
 		 529 aa  53.9  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  25.96 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  23.78 
 
 		 629 aa  47.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1933 aa  46.6  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  23.33 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  26.39 
 
 		 626 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  26.06 
 
 		 858 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  23.3 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  21.85 
 
 		 840 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  22.18 
 
 		 417 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  20.71 
 
 		 901 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3235  hypothetical protein  23.68 
 
 		 611 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  26.94 
 
 		 1848 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3322  hypothetical protein  23.6 
 
 		 603 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>