109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1868 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  100 
 
 		 870 aa  1701    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  32.77 
 
 		 400 aa  198  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  32.38 
 
 		 491 aa  197  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  32.77 
 
 		 403 aa  196  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  30.36 
 
 		 401 aa  184  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  26.98 
 
 		 626 aa  170  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  28.97 
 
 		 840 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  30.66 
 
 		 404 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  29.28 
 
 		 417 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  26.4 
 
 		 528 aa  129  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  24.79 
 
 		 553 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  28.84 
 
 		 378 aa  127  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  24.06 
 
 		 559 aa  124  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  32.59 
 
 		 538 aa  119  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  27.81 
 
 		 391 aa  119  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  27.18 
 
 		 408 aa  117  8.999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  27.74 
 
 		 629 aa  113  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  25.42 
 
 		 1131 aa  106  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  28.67 
 
 		 481 aa  103  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  28.06 
 
 		 502 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  31.64 
 
 		 258 aa  101  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  26.59 
 
 		 410 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  23.64 
 
 		 501 aa  84.3  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  34.01 
 
 		 1153 aa  80.5  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  34.01 
 
 		 1153 aa  80.5  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  26.26 
 
 		 432 aa  80.1  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  31.33 
 
 		 1337 aa  79  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  31.33 
 
 		 1337 aa  79  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  27.72 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  35.46 
 
 		 5517 aa  79  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  28.03 
 
 		 436 aa  76.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  33.91 
 
 		 200 aa  76.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  33.19 
 
 		 733 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1287 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  26.33 
 
 		 405 aa  73.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  33.03 
 
 		 2047 aa  70.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  30.47 
 
 		 2990 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  27.96 
 
 		 456 aa  69.7  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  32.77 
 
 		 5203 aa  67.8  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  23.32 
 
 		 938 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  24.25 
 
 		 917 aa  66.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.56 
 
 		 1848 aa  66.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  30.21 
 
 		 965 aa  65.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  30.21 
 
 		 965 aa  65.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  30.77 
 
 		 2876 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  28.44 
 
 		 708 aa  65.1  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  34.05 
 
 		 5166 aa  64.3  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  24.03 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  31.47 
 
 		 2656 aa  63.9  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  26.5 
 
 		 463 aa  63.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  29.07 
 
 		 387 aa  63.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  28.88 
 
 		 2890 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  26.22 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  24.68 
 
 		 714 aa  62  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  22.39 
 
 		 940 aa  62  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  35.08 
 
 		 1727 aa  61.2  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  28.21 
 
 		 382 aa  60.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  31.22 
 
 		 1263 aa  60.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  45.38 
 
 		 830 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.49 
 
 		 769 aa  59.3  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  30.98 
 
 		 3324 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  30.83 
 
 		 2112 aa  57.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  26.24 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  28.43 
 
 		 892 aa  56.2  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  39.67 
 
 		 916 aa  56.6  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  22.19 
 
 		 477 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  19.78 
 
 		 938 aa  55.8  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  24.08 
 
 		 2864 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  26.25 
 
 		 669 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  46.43 
 
 		 1394 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  31.51 
 
 		 436 aa  55.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  30.33 
 
 		 3373 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  27.23 
 
 		 688 aa  53.9  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  24.47 
 
 		 4433 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  25.89 
 
 		 2068 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  44.72 
 
 		 453 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  27.59 
 
 		 2604 aa  52.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  28.36 
 
 		 1531 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  31.58 
 
 		 480 aa  52.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1867  Cna B domain-containing protein  37.35 
 
 		 130 aa  52  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  24.04 
 
 		 471 aa  52  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  32.76 
 
 		 778 aa  52  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.18 
 
 		 1272 aa  51.6  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  27 
 
 		 5544 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  36.84 
 
 		 840 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  20.54 
 
 		 575 aa  49.7  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  38.39 
 
 		 555 aa  50.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  22.06 
 
 		 696 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  46.32 
 
 		 456 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  28.63 
 
 		 1519 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  26.37 
 
 		 733 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  32.64 
 
 		 671 aa  48.9  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  25.37 
 
 		 2286 aa  47.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  33.33 
 
 		 551 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  39.36 
 
 		 521 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  52.86 
 
 		 433 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1367  hypothetical protein  32.48 
 
 		 413 aa  46.2  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0144169  hitchhiker  0.000000182251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  46.51 
 
 		 455 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  37.9 
 
 		 1096 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0939  hypothetical protein  24.61 
 
 		 425 aa  45.8  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0324617  normal  0.305646 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>