85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1107 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  927    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  61.17 
 
 		 456 aa  505  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  61.21 
 
 		 471 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  46.88 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  40.19 
 
 		 485 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  42.96 
 
 		 436 aa  252  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  38.8 
 
 		 480 aa  226  9e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  37.95 
 
 		 513 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  33.55 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  35.58 
 
 		 3507 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  34.49 
 
 		 2068 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.86 
 
 		 1272 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  35.01 
 
 		 4433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  30.15 
 
 		 472 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  27.76 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  27.2 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  29.17 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  27.98 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  26.41 
 
 		 940 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  26.57 
 
 		 401 aa  100  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  29.59 
 
 		 2286 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  23.93 
 
 		 938 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  26.25 
 
 		 432 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  26.12 
 
 		 688 aa  86.7  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  28.28 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  33.24 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  26.58 
 
 		 501 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  25.87 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  30.34 
 
 		 917 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  25.95 
 
 		 502 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  27.07 
 
 		 708 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  23.4 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  26.42 
 
 		 840 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  27.25 
 
 		 930 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25.06 
 
 		 2807 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  25.64 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  26.5 
 
 		 870 aa  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  28.61 
 
 		 1848 aa  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1329 aa  63.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  29.01 
 
 		 676 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  30.36 
 
 		 930 aa  61.6  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  26.65 
 
 		 668 aa  61.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  23.16 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.04 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  27.93 
 
 		 579 aa  60.1  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1933 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  23.85 
 
 		 1131 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  25.73 
 
 		 812 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  27.8 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  27.96 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  25.63 
 
 		 714 aa  57.4  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  28.05 
 
 		 346 aa  57  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  29.53 
 
 		 664 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1969 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  25.54 
 
 		 1862 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  23.06 
 
 		 588 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  24.37 
 
 		 2198 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  25.63 
 
 		 258 aa  54.3  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  25.14 
 
 		 696 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  29.05 
 
 		 382 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  23.85 
 
 		 603 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  31.25 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  27.86 
 
 		 307 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  23.04 
 
 		 626 aa  50.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  26.55 
 
 		 1532 aa  50.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  25.95 
 
 		 1531 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  27.79 
 
 		 831 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  27.22 
 
 		 627 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  26.67 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  26.8 
 
 		 538 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  24.8 
 
 		 2554 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  24.09 
 
 		 559 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  21.69 
 
 		 481 aa  46.6  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2882  regulatory protein FlaEY  29.59 
 
 		 950 aa  46.6  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0301569  normal  0.06195 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  22.34 
 
 		 629 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  24.41 
 
 		 353 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  24.33 
 
 		 553 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  25 
 
 		 1976 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  23.35 
 
 		 528 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  24.01 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  22.9 
 
 		 752 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1068 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  23.67 
 
 		 801 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  26.43 
 
 		 3295 aa  43.5  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  27.3 
 
 		 709 aa  43.5  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>