65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0030 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  100 
 
 		 696 aa  1400    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  27.82 
 
 		 501 aa  151  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  28.84 
 
 		 940 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  29.43 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.56 
 
 		 1848 aa  98.6  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  28.97 
 
 		 472 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  27.73 
 
 		 938 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  27.27 
 
 		 401 aa  87.4  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1969 aa  87.4  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  28.03 
 
 		 2554 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1976 aa  78.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  25.28 
 
 		 553 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  26.43 
 
 		 688 aa  74.3  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  25.89 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  27.41 
 
 		 840 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  23.13 
 
 		 471 aa  72.8  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  26.49 
 
 		 400 aa  72.8  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  25.76 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  25.25 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  27.65 
 
 		 3295 aa  69.7  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  28.44 
 
 		 917 aa  68.9  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  23.84 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  26.24 
 
 		 626 aa  66.6  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  24.43 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  23.2 
 
 		 1131 aa  65.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  24.94 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  25.72 
 
 		 1531 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  21.72 
 
 		 1272 aa  62.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  26.45 
 
 		 4433 aa  62.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  24.73 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  25.43 
 
 		 2068 aa  62  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  26.68 
 
 		 801 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  24.31 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6283  hypothetical protein  25.64 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  25 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  25.22 
 
 		 429 aa  57  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  25.62 
 
 		 603 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  22.62 
 
 		 513 aa  54.7  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1329 aa  54.7  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  25.14 
 
 		 463 aa  54.3  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  20.61 
 
 		 528 aa  54.3  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  27.37 
 
 		 1152 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  28.71 
 
 		 410 aa  54.3  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  35.24 
 
 		 629 aa  53.9  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  27.54 
 
 		 258 aa  53.5  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  23.83 
 
 		 3507 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  37.8 
 
 		 2286 aa  52  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  23.27 
 
 		 708 aa  51.2  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  27.47 
 
 		 761 aa  50.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3674  Fibronectin type III domain protein  35.29 
 
 		 484 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457522  hitchhiker  0.000917339 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5046  hypothetical protein  36.67 
 
 		 189 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.401847 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  22.06 
 
 		 870 aa  49.7  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  23.64 
 
 		 404 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  22.54 
 
 		 481 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  29.22 
 
 		 1862 aa  47.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1256  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1742 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.706076  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  22.71 
 
 		 553 aa  47.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1357  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1743 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0819282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  21.73 
 
 		 559 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1449  hypothetical protein  23.39 
 
 		 411 aa  46.2  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2592  hypothetical protein  38.16 
 
 		 1743 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  30.34 
 
 		 200 aa  45.8  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  28.57 
 
 		 382 aa  45.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  29.17 
 
 		 938 aa  45.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  23.65 
 
 		 714 aa  44.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>