68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1552 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 1131 aa  2258    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  38.48 
 
 		 626 aa  259  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  32.13 
 
 		 840 aa  199  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  35.25 
 
 		 400 aa  190  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  32.3 
 
 		 481 aa  188  5e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  35.42 
 
 		 401 aa  188  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  34.1 
 
 		 491 aa  179  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  34.05 
 
 		 528 aa  179  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  32.99 
 
 		 403 aa  167  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  34.73 
 
 		 391 aa  162  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  41.48 
 
 		 258 aa  157  8e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  35.79 
 
 		 404 aa  142  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  30.89 
 
 		 378 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  30.16 
 
 		 408 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  31.43 
 
 		 432 aa  121  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  30.22 
 
 		 559 aa  118  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  41.18 
 
 		 200 aa  118  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  30.22 
 
 		 553 aa  117  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  30.49 
 
 		 382 aa  114  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0022  fibronectin type III domain-containing protein  26.28 
 
 		 730 aa  113  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0168573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  29.56 
 
 		 629 aa  111  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  24.93 
 
 		 870 aa  105  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.02 
 
 		 769 aa  100  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  28.77 
 
 		 472 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  26.59 
 
 		 940 aa  98.2  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  27.35 
 
 		 575 aa  96.3  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  31.41 
 
 		 714 aa  93.2  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  26.68 
 
 		 410 aa  92.8  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  28.23 
 
 		 417 aa  89.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  24.66 
 
 		 708 aa  85.5  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  27.88 
 
 		 502 aa  83.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  25.68 
 
 		 501 aa  78.2  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  29.31 
 
 		 1862 aa  76.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  27.62 
 
 		 938 aa  73.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  34.75 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  26.69 
 
 		 538 aa  70.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  25.08 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  29.46 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  26.05 
 
 		 603 aa  68.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  23.2 
 
 		 696 aa  66.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  27.93 
 
 		 917 aa  66.2  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  31.94 
 
 		 1848 aa  64.7  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  26.09 
 
 		 938 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  36.79 
 
 		 486 aa  63.5  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  23.79 
 
 		 553 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  25.56 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  23.96 
 
 		 463 aa  57  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  24.54 
 
 		 387 aa  57  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  23.36 
 
 		 1230 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  29.17 
 
 		 669 aa  55.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  26.33 
 
 		 656 aa  55.5  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  26.24 
 
 		 688 aa  54.7  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  26.27 
 
 		 761 aa  54.3  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1287 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  30.23 
 
 		 999 aa  53.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1611  LVIVD repeat-containing protein  24.44 
 
 		 568 aa  51.6  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  25.25 
 
 		 3295 aa  50.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1660  hypothetical protein  27.46 
 
 		 336 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  23.61 
 
 		 2554 aa  50.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  24.93 
 
 		 683 aa  49.3  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  25.07 
 
 		 692 aa  48.9  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0633  fibronectin, type III domain-containing protein  31.2 
 
 		 317 aa  49.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  23.43 
 
 		 741 aa  47.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.26 
 
 		 795 aa  48.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  24.86 
 
 		 2068 aa  46.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.46 
 
 		 1272 aa  45.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  23.66 
 
 		 2286 aa  44.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4731  WD40 domain protein beta Propeller  23.81 
 
 		 509 aa  44.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>