26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3488 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  100 
 
 		 669 aa  1355    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  31.49 
 
 		 1170 aa  87.4  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0006  hypothetical protein  30.86 
 
 		 184 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000384761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  27.3 
 
 		 400 aa  73.6  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  24.2 
 
 		 491 aa  69.7  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  26.77 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  26.69 
 
 		 840 aa  67.8  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  24.09 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  31.07 
 
 		 658 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  23.11 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  22.88 
 
 		 559 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  24.45 
 
 		 626 aa  57.4  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  34.34 
 
 		 1216 aa  57.4  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  29.17 
 
 		 1131 aa  55.8  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  26.62 
 
 		 870 aa  54.7  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  22.18 
 
 		 432 aa  53.9  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  29.52 
 
 		 404 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  34.75 
 
 		 258 aa  53.9  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  23.38 
 
 		 410 aa  52.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  32.23 
 
 		 200 aa  51.6  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  24.89 
 
 		 391 aa  48.9  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  28.12 
 
 		 1079 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  26.04 
 
 		 994 aa  47.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.21 
 
 		 769 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  27.98 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  42.11 
 
 		 481 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>