62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0619 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  100 
 
 		 1216 aa  2433    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  48.77 
 
 		 1170 aa  585  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  47.66 
 
 		 775 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3897  hypothetical protein  42.69 
 
 		 859 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  normal  0.272372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  33.4 
 
 		 743 aa  159  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  31.42 
 
 		 799 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  40.69 
 
 		 1342 aa  145  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 2192 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  51.16 
 
 		 1656 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  31.04 
 
 		 1332 aa  131  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  28.15 
 
 		 507 aa  127  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  28.36 
 
 		 852 aa  126  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1919  hypothetical protein  37.5 
 
 		 872 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2776  Fibronectin type III domain protein  44.23 
 
 		 823 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000481721  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  30.61 
 
 		 1092 aa  108  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0557  hypothetical protein  33.83 
 
 		 295 aa  101  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48710  predicted protein  25.28 
 
 		 969 aa  92.8  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.873734  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1010 aa  85.9  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  26.44 
 
 		 1296 aa  75.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  28.25 
 
 		 1526 aa  74.7  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1106 aa  72  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1318 aa  71.6  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  45.38 
 
 		 994 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  29.33 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  25.52 
 
 		 350 aa  67.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  40.23 
 
 		 658 aa  66.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.43 
 
 		 2031 aa  63.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  25 
 
 		 1055 aa  63.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  27.23 
 
 		 794 aa  62.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0006  hypothetical protein  36.56 
 
 		 184 aa  58.9  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000384761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  25.17 
 
 		 1755 aa  58.2  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1027  hypothetical protein  37.25 
 
 		 1525 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.275206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  31.85 
 
 		 14944 aa  57.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  34.34 
 
 		 669 aa  57.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45737  predicted protein  35.54 
 
 		 882 aa  54.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.194505  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  30.6 
 
 		 2713 aa  54.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1969 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.7 
 
 		 1383 aa  53.5  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.95 
 
 		 1507 aa  53.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  25.11 
 
 		 792 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  40.96 
 
 		 1550 aa  52.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  23.71 
 
 		 799 aa  52.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  29.23 
 
 		 417 aa  52  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  24.82 
 
 		 822 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  43.82 
 
 		 540 aa  49.7  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  27.54 
 
 		 1288 aa  48.9  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3628  hypothetical protein  27.56 
 
 		 330 aa  49.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0867814  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.1 
 
 		 1607 aa  49.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  39.13 
 
 		 714 aa  48.5  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  26.57 
 
 		 528 aa  48.5  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  27.96 
 
 		 1371 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  39.77 
 
 		 1130 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  33.67 
 
 		 2402 aa  47.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2330  hypothetical protein  34.95 
 
 		 865 aa  47.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04803  hypothetical protein  37.33 
 
 		 441 aa  46.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.151498 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  27.84 
 
 		 3563 aa  46.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1246  putative lipoprotein  31.25 
 
 		 842 aa  46.2  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.229851  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1976 aa  45.8  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  27.13 
 
 		 951 aa  45.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  26.29 
 
 		 1483 aa  45.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  26.67 
 
 		 3793 aa  45.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  28.25 
 
 		 951 aa  45.1  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>