22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1027 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1027  hypothetical protein  100 
 
 		 1525 aa  3088    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.275206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  29.22 
 
 		 1371 aa  75.1  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.44 
 
 		 1773 aa  73.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  27.52 
 
 		 1389 aa  71.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.76 
 
 		 1797 aa  65.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  24.6 
 
 		 650 aa  62.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  37.25 
 
 		 1216 aa  57.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.17 
 
 		 1783 aa  55.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  30.94 
 
 		 775 aa  53.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  27.89 
 
 		 1466 aa  51.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1245 aa  51.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  31.79 
 
 		 792 aa  50.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  26.41 
 
 		 822 aa  50.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  30.65 
 
 		 1162 aa  48.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  24.25 
 
 		 2270 aa  48.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1228 aa  48.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  27.75 
 
 		 1606 aa  47  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  27.1 
 
 		 984 aa  47  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  28.69 
 
 		 2278 aa  46.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  39.13 
 
 		 3562 aa  45.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  29.94 
 
 		 794 aa  45.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  29.19 
 
 		 1361 aa  45.1  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>