32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1790 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  100 
 
 		 799 aa  1612    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  61.08 
 
 		 1332 aa  869    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  63.91 
 
 		 1092 aa  776    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1792  hypothetical protein  77.85 
 
 		 932 aa  497  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000052319  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1791  hypothetical protein  71.43 
 
 		 669 aa  452  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0011076  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1789  hypothetical protein  70 
 
 		 1123 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  38.02 
 
 		 852 aa  282  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  38.17 
 
 		 507 aa  249  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  36.22 
 
 		 743 aa  210  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  38.12 
 
 		 2192 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  31.44 
 
 		 1170 aa  168  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  33.27 
 
 		 775 aa  167  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  30.75 
 
 		 1296 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  30.75 
 
 		 1216 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  48.53 
 
 		 1106 aa  142  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1318 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  29.78 
 
 		 1010 aa  127  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1263 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  35.66 
 
 		 1526 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  38.27 
 
 		 417 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  34.25 
 
 		 350 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1055 aa  97.4  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  33.5 
 
 		 441 aa  90.5  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.66 
 
 		 2031 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  32.74 
 
 		 1755 aa  74.7  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3282  hypothetical protein  40.97 
 
 		 149 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.290972  hitchhiker  0.000227158 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1750 aa  68.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  37.96 
 
 		 5453 aa  65.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  31.01 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  35.37 
 
 		 717 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.25 
 
 		 512 aa  48.1  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  27.53 
 
 		 591 aa  47.8  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>