67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2043 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 2031 aa  4100    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  34.54 
 
 		 1755 aa  388  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0952  fibronectin, type III domain-containing protein  38.67 
 
 		 486 aa  124  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3967  fibronectin, type III domain-containing protein  42.24 
 
 		 486 aa  120  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.476574  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  37.16 
 
 		 892 aa  114  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  31.44 
 
 		 1750 aa  113  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  71.13 
 
 		 1011 aa  112  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  29.65 
 
 		 1332 aa  109  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  32.79 
 
 		 2192 aa  94.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  62.1 
 
 		 994 aa  94.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  30.11 
 
 		 799 aa  91.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  27.21 
 
 		 743 aa  80.1  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  30.92 
 
 		 1092 aa  78.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  29.68 
 
 		 852 aa  77  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  31.56 
 
 		 3066 aa  77  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1055 aa  75.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  45.16 
 
 		 1987 aa  72.8  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  26.36 
 
 		 1296 aa  70.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  50.7 
 
 		 692 aa  70.5  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  40.4 
 
 		 446 aa  68.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  34.15 
 
 		 1188 aa  65.9  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  28 
 
 		 1216 aa  65.9  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  42.65 
 
 		 830 aa  65.5  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  26.43 
 
 		 507 aa  65.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  51.35 
 
 		 1107 aa  63.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  25 
 
 		 1318 aa  61.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  25.12 
 
 		 665 aa  60.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  50.68 
 
 		 767 aa  60.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  27.55 
 
 		 775 aa  58.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  27.8 
 
 		 1831 aa  58.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  44.74 
 
 		 456 aa  58.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  52.31 
 
 		 14609 aa  58.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  36.27 
 
 		 5453 aa  57.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  33.97 
 
 		 863 aa  57.4  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  30.11 
 
 		 1170 aa  57  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  30.31 
 
 		 1394 aa  54.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 462 aa  53.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  49.12 
 
 		 1316 aa  52.8  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  27.25 
 
 		 1526 aa  52.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.37 
 
 		 428 aa  52  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.52 
 
 		 884 aa  52  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  43.68 
 
 		 4009 aa  52  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3183  hypothetical protein  39.13 
 
 		 286 aa  52  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1246  putative lipoprotein  28.94 
 
 		 842 aa  50.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.229851  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1119  hypothetical protein  33.55 
 
 		 476 aa  50.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.993118  normal  0.376129 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  53.23 
 
 		 1487 aa  50.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  51.92 
 
 		 640 aa  50.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  32.8 
 
 		 1732 aa  48.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  30.5 
 
 		 341 aa  48.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  26.81 
 
 		 1197 aa  48.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  43.04 
 
 		 866 aa  48.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  36.17 
 
 		 483 aa  48.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  34.19 
 
 		 153 aa  47.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  30.56 
 
 		 735 aa  47.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  42.5 
 
 		 3907 aa  46.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0638  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  33.9 
 
 		 1407 aa  47  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.652963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  35.77 
 
 		 474 aa  46.6  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  35.22 
 
 		 2074 aa  46.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  40 
 
 		 3027 aa  46.6  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1106 aa  46.2  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  35.64 
 
 		 550 aa  46.2  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  32.46 
 
 		 987 aa  46.2  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  27.56 
 
 		 4022 aa  45.8  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  32.82 
 
 		 461 aa  45.8  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  35.9 
 
 		 4357 aa  45.8  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  29.46 
 
 		 505 aa  45.8  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.6 
 
 		 463 aa  45.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>