39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0292 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 463 aa  937    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.32 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.34 
 
 		 428 aa  210  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  36.14 
 
 		 759 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  34.85 
 
 		 677 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.96 
 
 		 1066 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.67 
 
 		 512 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  25.7 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.06 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  35.97 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1945  hypothetical protein  31.16 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  30.37 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  28.79 
 
 		 368 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  23.96 
 
 		 665 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  26.5 
 
 		 520 aa  54.3  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  28.72 
 
 		 341 aa  53.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  30.65 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2960  PKD domain containing protein  33.06 
 
 		 687 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3548  hypothetical protein  58.14 
 
 		 505 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896627  normal  0.0134633 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1934  hypothetical protein  26.07 
 
 		 360 aa  51.2  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2868  PKD domain containing protein  32.23 
 
 		 687 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  25.95 
 
 		 563 aa  50.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5780  hypothetical protein  43.4 
 
 		 502 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  29.45 
 
 		 480 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  38.03 
 
 		 1526 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  26.42 
 
 		 747 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2881  PKD domain containing protein  27.27 
 
 		 588 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2973  PKD domain containing protein  27.27 
 
 		 586 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234709  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  29.46 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  29.91 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  25 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.53 
 
 		 2031 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  43.55 
 
 		 1170 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1935  hypothetical protein  25.82 
 
 		 358 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151604  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  32.31 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4605  hypothetical protein  27.8 
 
 		 571 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.723744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 565 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2763  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1117 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2856  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1117 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00658326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>