45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4387 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1038    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.2 
 
 		 500 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  47.7 
 
 		 512 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  41.1 
 
 		 520 aa  323  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4699  hypothetical protein  41.76 
 
 		 472 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0214281  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3548  hypothetical protein  31.79 
 
 		 505 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896627  normal  0.0134633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4180  parallel beta-helix repeat protein protein  31.57 
 
 		 513 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.0401044 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  26.15 
 
 		 563 aa  97.4  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  28.03 
 
 		 677 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  26.64 
 
 		 759 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1929  hypothetical protein  26.45 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  23.61 
 
 		 547 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  29.41 
 
 		 665 aa  70.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  31.45 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  31.7 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  33.63 
 
 		 458 aa  67  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1066 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  32.62 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  27.33 
 
 		 415 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0468  protein of unknown function DUF1565  43.59 
 
 		 653 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.672167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1024 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.37 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  25.86 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2354  hypothetical protein  24.76 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.87 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  32.84 
 
 		 689 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  30.27 
 
 		 491 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.94 
 
 		 456 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  34.29 
 
 		 965 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  32.67 
 
 		 489 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1549  putative outer membrane protein  37.33 
 
 		 644 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  26.58 
 
 		 437 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  26.29 
 
 		 439 aa  50.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  26.01 
 
 		 437 aa  50.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.49 
 
 		 694 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1935  hypothetical protein  21.04 
 
 		 358 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  39.13 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2850  hypothetical protein  28.57 
 
 		 540 aa  47.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000112945  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0233  putative outer membrane protein  36.99 
 
 		 638 aa  47.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317467  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  26.16 
 
 		 338 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1945  hypothetical protein  27.98 
 
 		 357 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266069  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  31.82 
 
 		 341 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0151  ATP-dependent DNA helicase RepA  22.15 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.211461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  25.97 
 
 		 565 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  32.04 
 
 		 480 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>