13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1935 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1935  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  724    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1934  hypothetical protein  74.47 
 
 		 360 aa  474  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1945  hypothetical protein  51.56 
 
 		 357 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266069  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  27.27 
 
 		 547 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  20.45 
 
 		 502 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.63 
 
 		 510 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  27.06 
 
 		 341 aa  46.2  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.82 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.23 
 
 		 694 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  29.73 
 
 		 899 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1667  hypothetical protein  31.15 
 
 		 493 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  26.57 
 
 		 458 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  25.52 
 
 		 480 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>