15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1667 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1667  hypothetical protein  100 
 
 		 493 aa  989    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18500  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  28.47 
 
 		 543 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0371446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1600  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  28.47 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.911541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1026  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.85 
 
 		 511 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.931695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1058  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.13 
 
 		 536 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0674089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4566  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.92 
 
 		 519 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10920  Mannuronan C-5-Epimerase  26 
 
 		 526 aa  79.7  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1283  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.69 
 
 		 557 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.465255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4442  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.69 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.094084  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1238  alginate biosynthesis protein AlgG  24.57 
 
 		 536 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0884  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.42 
 
 		 519 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0955  carbohydrate binding and sugar hydrolysis  23.78 
 
 		 523 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.21055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1935  hypothetical protein  31.15 
 
 		 358 aa  43.9  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151604  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  28.06 
 
 		 1242 aa  43.9  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4605  hypothetical protein  35 
 
 		 571 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.723744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>