15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1934 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1934  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  732    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1935  hypothetical protein  74.47 
 
 		 358 aa  476  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1945  hypothetical protein  47.72 
 
 		 357 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266069  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  26.67 
 
 		 341 aa  52.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.23 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  33.33 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.49 
 
 		 512 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.96 
 
 		 694 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  25.45 
 
 		 759 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  25.78 
 
 		 480 aa  47  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  28.57 
 
 		 547 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  30.33 
 
 		 520 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  21.67 
 
 		 500 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  28.28 
 
 		 665 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1667  hypothetical protein  31.15 
 
 		 493 aa  43.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>