34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0361 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  691    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  82.94 
 
 		 480 aa  582  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  35.9 
 
 		 446 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  33.76 
 
 		 368 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  28 
 
 		 759 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  27.32 
 
 		 677 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.99 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  26.09 
 
 		 665 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.7 
 
 		 1066 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.61 
 
 		 512 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  44.83 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  27.51 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  34.91 
 
 		 489 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  25.29 
 
 		 563 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  33.61 
 
 		 653 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1934  hypothetical protein  26.67 
 
 		 360 aa  53.1  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  27.21 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.41 
 
 		 694 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.72 
 
 		 463 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.5 
 
 		 456 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  33.05 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.26 
 
 		 500 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1024 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.5 
 
 		 2031 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  35.19 
 
 		 468 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5780  hypothetical protein  40 
 
 		 502 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  25.22 
 
 		 437 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1935  hypothetical protein  27.06 
 
 		 358 aa  46.2  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  27.43 
 
 		 439 aa  46.6  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  31.82 
 
 		 502 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2766  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1106 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000116349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3548  hypothetical protein  35.94 
 
 		 505 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896627  normal  0.0134633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1888  hypothetical protein  33.04 
 
 		 616 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000914  putative exopolygalacturonate lyase  24.73 
 
 		 742 aa  43.1  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>