37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0371 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  961    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  82.94 
 
 		 341 aa  583  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  35.59 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  32.84 
 
 		 368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.48 
 
 		 428 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.68 
 
 		 1066 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  27.39 
 
 		 759 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  26.75 
 
 		 677 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.5 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.62 
 
 		 512 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  26.88 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  33.33 
 
 		 665 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1090  hypothetical protein  34.11 
 
 		 771 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  46.03 
 
 		 520 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  35.24 
 
 		 895 aa  57  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  26.15 
 
 		 338 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  33.61 
 
 		 653 aa  53.5  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  41.54 
 
 		 547 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  27.21 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.87 
 
 		 694 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  24.2 
 
 		 563 aa  51.2  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.51 
 
 		 500 aa  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0240  hypothetical protein  32.18 
 
 		 649 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9524  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5780  hypothetical protein  26.17 
 
 		 502 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.45 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  25.42 
 
 		 437 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1024 aa  47  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1934  hypothetical protein  25.87 
 
 		 360 aa  47.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  35.19 
 
 		 468 aa  47  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3548  hypothetical protein  35.14 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896627  normal  0.0134633 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000914  putative exopolygalacturonate lyase  23.58 
 
 		 742 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  32.04 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  26.72 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.11 
 
 		 2031 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2763  hypothetical protein  40 
 
 		 1117 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1888  hypothetical protein  33.04 
 
 		 616 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2856  hypothetical protein  40 
 
 		 1117 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00658326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>