51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1931 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  100 
 
 		 458 aa  934    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  44.74 
 
 		 415 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  41.03 
 
 		 437 aa  299  8e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  41.45 
 
 		 437 aa  295  8e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  40.14 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  40.41 
 
 		 439 aa  289  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  37 
 
 		 489 aa  226  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1528  Parallel beta-helix repeat protein  33.86 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2946  hypothetical protein  33.26 
 
 		 733 aa  177  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000153655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1887  hypothetical protein  33.8 
 
 		 426 aa  173  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00565  pectate lyase L  50 
 
 		 217 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  31.75 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  31.83 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  32.05 
 
 		 750 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  29.86 
 
 		 653 aa  133  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  28.6 
 
 		 410 aa  127  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  29.82 
 
 		 338 aa  123  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.17 
 
 		 694 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26480  hypothetical protein  32.57 
 
 		 907 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178741  normal  0.268207 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3869  fibronectin type III domain-containing protein  30.23 
 
 		 1431 aa  93.2  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.849627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1888  hypothetical protein  28.7 
 
 		 616 aa  92.8  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  29.18 
 
 		 576 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4196  exopolygalacturonate lyase  27.52 
 
 		 734 aa  89.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4259  exopolygalacturonate lyase  28.12 
 
 		 744 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  29.63 
 
 		 540 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3996  exopolygalacturonate lyase  28.05 
 
 		 734 aa  84.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  28.26 
 
 		 1409 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4562  exopolygalacturonate lyase  28.17 
 
 		 744 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000914  putative exopolygalacturonate lyase  27.44 
 
 		 742 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  33.63 
 
 		 502 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  26.03 
 
 		 922 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.82 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4134  Pectate disaccharide-lyase  25.36 
 
 		 700 aa  64.3  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.275523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  36.73 
 
 		 965 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  38.24 
 
 		 951 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.8 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1024 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.4 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  32.77 
 
 		 689 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  39.78 
 
 		 2286 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  30.3 
 
 		 520 aa  51.6  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  30.16 
 
 		 627 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  25.71 
 
 		 665 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.56 
 
 		 512 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.14 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  31.53 
 
 		 839 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  31.58 
 
 		 832 aa  43.9  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4699  hypothetical protein  27.82 
 
 		 472 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0214281  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1935  hypothetical protein  26.57 
 
 		 358 aa  43.1  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  43.48 
 
 		 563 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  44.19 
 
 		 446 aa  43.1  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>