36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0455 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  100 
 
 
563 aa  1159    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  26.07 
 
 
502 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.05 
 
 
512 aa  100  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.25 
 
 
500 aa  94.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  28.33 
 
 
520 aa  90.9  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  28.64 
 
 
759 aa  77.8  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3548  hypothetical protein  27.47 
 
 
505 aa  77  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896627  normal  0.0134633 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.89 
 
 
1066 aa  70.1  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  27.63 
 
 
677 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.35 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  25.23 
 
 
446 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  25.99 
 
 
341 aa  64.7  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  23.44 
 
 
665 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  25.35 
 
 
480 aa  62  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  26.4 
 
 
468 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4180  parallel beta-helix repeat protein protein  24.34 
 
 
513 aa  57  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.0401044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.84 
 
 
428 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  26.64 
 
 
368 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2850  hypothetical protein  27.81 
 
 
540 aa  54.3  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000112945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.51 
 
 
1412 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  30.65 
 
 
852 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  37.36 
 
 
1024 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3849  Parallel beta-helix repeat protein  23.91 
 
 
526 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  27.67 
 
 
415 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2766  hypothetical protein  25.87 
 
 
1106 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000116349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1515  hypothetical protein  22.16 
 
 
586 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000161589  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  45.45 
 
 
458 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2350  hypothetical protein  23.78 
 
 
473 aa  47.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.9 
 
 
463 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  36.14 
 
 
441 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  30 
 
 
437 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  25.68 
 
 
230 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3866  hypothetical protein  25.2 
 
 
535 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.991992  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  33.33 
 
 
489 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1105  hypothetical protein  26.43 
 
 
537 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  25.89 
 
 
863 aa  43.9  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>