53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1882 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 
428 aa  875    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  66.58 
 
 
456 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.87 
 
 
463 aa  206  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  40.73 
 
 
677 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  39.71 
 
 
759 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.87 
 
 
1066 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  25.97 
 
 
489 aa  90.9  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  27.48 
 
 
480 aa  86.3  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  25.99 
 
 
341 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.63 
 
 
512 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.35 
 
 
500 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  33.78 
 
 
338 aa  63.9  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  22.77 
 
 
665 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  26.05 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  23.8 
 
 
458 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  29.87 
 
 
502 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  24.09 
 
 
415 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25 
 
 
541 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2575  Parallel beta-helix repeat protein  32.67 
 
 
495 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116637  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  25 
 
 
563 aa  53.9  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5780  hypothetical protein  29.89 
 
 
502 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  33.81 
 
 
520 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.37 
 
 
2031 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2257  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.02 
 
 
496 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.719772 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  25.33 
 
 
437 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  32.84 
 
 
446 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  31.68 
 
 
1024 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  32.09 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.33 
 
 
694 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  49.02 
 
 
1755 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5474  hypothetical protein  24.11 
 
 
460 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2763  hypothetical protein  44.64 
 
 
1117 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3227  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.14 
 
 
537 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751454  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  27.67 
 
 
547 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  28.48 
 
 
468 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  32 
 
 
417 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  37.07 
 
 
965 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.82 
 
 
905 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2868  PKD domain containing protein  31.85 
 
 
687 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0468  protein of unknown function DUF1565  35.71 
 
 
653 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.672167  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2960  PKD domain containing protein  31.85 
 
 
687 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2856  hypothetical protein  42.86 
 
 
1117 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00658326  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  25.75 
 
 
750 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3223  hypothetical protein  30.47 
 
 
462 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.682465  normal  0.039169 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  24.89 
 
 
437 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4158  hypothetical protein  32.97 
 
 
508 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0491983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  31.11 
 
 
1236 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  36.25 
 
 
1206 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3548  hypothetical protein  21.68 
 
 
505 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896627  normal  0.0134633 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1463  hypothetical protein  24.53 
 
 
596 aa  43.9  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2881  PKD domain containing protein  40.82 
 
 
588 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2973  PKD domain containing protein  40.82 
 
 
586 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234709  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  22.67 
 
 
422 aa  43.1  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>