27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4699 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4699  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  944    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0214281  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  41.58 
 
 		 502 aa  282  8.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.13 
 
 		 500 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.69 
 
 		 512 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  34.75 
 
 		 520 aa  189  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4180  parallel beta-helix repeat protein protein  27.44 
 
 		 513 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.0401044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3548  hypothetical protein  26.94 
 
 		 505 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896627  normal  0.0134633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  27.95 
 
 		 665 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  30.07 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1929  hypothetical protein  26.62 
 
 		 547 aa  55.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  31.58 
 
 		 458 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.66 
 
 		 694 aa  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  44.44 
 
 		 576 aa  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  36.45 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  28.34 
 
 		 2286 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  30.71 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  39 
 
 		 689 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  35.04 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  35.04 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  29.94 
 
 		 491 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  34.29 
 
 		 677 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  30.36 
 
 		 951 aa  46.6  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  28.48 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  28.5 
 
 		 839 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  30.43 
 
 		 759 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  31.03 
 
 		 965 aa  43.5  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>