18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4180 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4180  parallel beta-helix repeat protein protein  100 
 
 		 513 aa  1024    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.0401044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.76 
 
 		 500 aa  204  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3548  hypothetical protein  30.72 
 
 		 505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896627  normal  0.0134633 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  31.71 
 
 		 502 aa  189  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.41 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  30.57 
 
 		 520 aa  154  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4699  hypothetical protein  27.93 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0214281  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  26.61 
 
 		 563 aa  67  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  36.04 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1929  hypothetical protein  20.77 
 
 		 547 aa  62  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  24.95 
 
 		 665 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.38 
 
 		 428 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.39 
 
 		 456 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  32.11 
 
 		 541 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  31.2 
 
 		 410 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  50 
 
 		 1755 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2575  Parallel beta-helix repeat protein  28.38 
 
 		 495 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3227  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.83 
 
 		 537 aa  43.5  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751454  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>