More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6850 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 565 aa  1122    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  39.86 
 
 		 547 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5086  hypothetical protein  29.27 
 
 		 421 aa  130  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1313  hypothetical protein  24.76 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.89 
 
 		 1029 aa  94.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  37.89 
 
 		 1029 aa  94.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.15 
 
 		 1180 aa  87.4  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  42.28 
 
 		 2567 aa  86.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  40.97 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.82 
 
 		 2346 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  41.1 
 
 		 574 aa  81.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  40.76 
 
 		 652 aa  80.5  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  38.41 
 
 		 1346 aa  80.1  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  41.67 
 
 		 448 aa  79.7  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2256  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  45.36 
 
 		 496 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.532736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  39.86 
 
 		 546 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  56.82 
 
 		 1883 aa  77.4  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  38.99 
 
 		 1019 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2307  hemolysin-type calcium-binding region  36.92 
 
 		 145 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.138932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  41.51 
 
 		 1055 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  33.52 
 
 		 589 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  40.44 
 
 		 1072 aa  74.7  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  40 
 
 		 813 aa  74.7  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.2 
 
 		 588 aa  74.3  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  41.67 
 
 		 621 aa  73.9  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  46.6 
 
 		 5171 aa  73.6  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  42.5 
 
 		 4285 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  47.92 
 
 		 2542 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  39.55 
 
 		 531 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  37.78 
 
 		 614 aa  71.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.1 
 
 		 2678 aa  71.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4158  hypothetical protein  30.93 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0491983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2574  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  42.68 
 
 		 497 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.053652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  41.25 
 
 		 1236 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  38.46 
 
 		 917 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  42.34 
 
 		 2743 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.46 
 
 		 547 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  40.74 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.22 
 
 		 2239 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  43.88 
 
 		 1434 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  39.55 
 
 		 531 aa  69.7  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3227  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.08 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2575  Parallel beta-helix repeat protein  37.11 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  35.37 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  49.37 
 
 		 9867 aa  67.8  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.08 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  36.92 
 
 		 1037 aa  67.4  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  51.85 
 
 		 6662 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  51.85 
 
 		 6779 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.85 
 
 		 6683 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  48.84 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  48.84 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.4 
 
 		 3427 aa  67.4  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  34.94 
 
 		 327 aa  67  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  53.52 
 
 		 3209 aa  67  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  44.9 
 
 		 5218 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.94 
 
 		 1415 aa  67  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  46.88 
 
 		 8682 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0628  hypothetical protein  34.27 
 
 		 694 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244367 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  47.31 
 
 		 202 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  47.31 
 
 		 202 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  36.23 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  46.94 
 
 		 1394 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  45.83 
 
 		 9030 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.86 
 
 		 5962 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  38.35 
 
 		 556 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  42.72 
 
 		 4678 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.89 
 
 		 2812 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2257  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  35.05 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719772 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  45.79 
 
 		 1839 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  45.61 
 
 		 1610 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  44.55 
 
 		 1502 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  47.83 
 
 		 4106 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  45.16 
 
 		 2704 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2850  hypothetical protein  30.9 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000112945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  37.66 
 
 		 1206 aa  64.3  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  40.14 
 
 		 2097 aa  64.3  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  46.46 
 
 		 856 aa  64.3  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  39.06 
 
 		 1017 aa  64.3  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  39.86 
 
 		 1112 aa  63.9  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  51.35 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  39.06 
 
 		 1022 aa  63.9  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  41.22 
 
 		 1175 aa  63.9  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  37.82 
 
 		 5442 aa  63.9  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  47.31 
 
 		 1895 aa  63.9  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  46.15 
 
 		 1424 aa  63.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  33.95 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  44.33 
 
 		 6753 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  50.63 
 
 		 2125 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  37.5 
 
 		 768 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  53.33 
 
 		 537 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  45.57 
 
 		 2701 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  43.37 
 
 		 759 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1952  triacylglycerol lipase  46.74 
 
 		 622 aa  62.8  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  54.29 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  48.15 
 
 		 16322 aa  62.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  53.85 
 
 		 745 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  40.91 
 
 		 677 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  51.22 
 
 		 1403 aa  62.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  46.15 
 
 		 686 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>