12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4605 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3866  hypothetical protein  69.14 
 
 		 535 aa  780    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.991992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4605  hypothetical protein  100 
 
 		 571 aa  1162    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.723744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3849  Parallel beta-helix repeat protein  40.73 
 
 		 526 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4326  hypothetical protein  32.88 
 
 		 511 aa  216  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  27.48 
 
 		 1771 aa  127  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2615  hypothetical protein  28.95 
 
 		 470 aa  87  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2487  parallel beta-helix repeat protein  25.31 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.67625 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3463  parallel beta-helix repeat protein  28.81 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2252  hypothetical protein  27.91 
 
 		 695 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5860  hypothetical protein  24.46 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  0.516752 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5780  hypothetical protein  42.42 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  29.46 
 
 		 1296 aa  43.9  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>