20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5780 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5780  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1006    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3809  hypothetical protein  30.22 
 
 		 470 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289031  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3808  hypothetical protein  27.8 
 
 		 493 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.532323  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3807  hypothetical protein  23.06 
 
 		 600 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485246  normal  0.13404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.77 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  26.42 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  29.44 
 
 		 665 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2973  PKD domain containing protein  37.93 
 
 		 586 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234709  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.89 
 
 		 428 aa  53.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2881  PKD domain containing protein  37.93 
 
 		 588 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2582  hypothetical protein  26.1 
 
 		 626 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.296353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  43.4 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  26.17 
 
 		 480 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  40 
 
 		 341 aa  47.4  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4605  hypothetical protein  53.33 
 
 		 571 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.723744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  27.97 
 
 		 1170 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  47.37 
 
 		 2031 aa  44.3  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  30.88 
 
 		 5453 aa  44.3  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2856  hypothetical protein  46.15 
 
 		 1117 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00658326  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  27.72 
 
 		 3066 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>