187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3450 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  100 
 
 		 5453 aa  10980    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  23.99 
 
 		 3793 aa  137  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  30 
 
 		 991 aa  126  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  29.63 
 
 		 1288 aa  114  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  28.41 
 
 		 1266 aa  104  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.33 
 
 		 1800 aa  99  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  26.57 
 
 		 886 aa  95.1  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  26.64 
 
 		 1657 aa  92.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  26.07 
 
 		 2713 aa  90.9  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4069  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.82 
 
 		 490 aa  90.5  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3862  3-dehydroshikimate dehydratase (DHS dehydratase) (DHSase)  28.13 
 
 		 489 aa  88.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  27.17 
 
 		 2270 aa  87  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1329 aa  85.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  37.75 
 
 		 507 aa  82.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  25.71 
 
 		 1862 aa  82  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  25.36 
 
 		 1814 aa  82  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  25.05 
 
 		 1748 aa  81.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  27.25 
 
 		 752 aa  79.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1313 aa  79.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1055 aa  76.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  29.18 
 
 		 978 aa  75.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  23.76 
 
 		 2176 aa  74.7  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1682 aa  73.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  30.08 
 
 		 561 aa  73.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  25.66 
 
 		 2272 aa  73.6  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  29.7 
 
 		 1732 aa  73.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  28.14 
 
 		 735 aa  72.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  27.17 
 
 		 963 aa  72.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  26.59 
 
 		 1606 aa  72  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1547 aa  71.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  28.79 
 
 		 2000 aa  70.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  25.44 
 
 		 1620 aa  70.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  29.67 
 
 		 3295 aa  70.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  26.94 
 
 		 743 aa  69.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  28.7 
 
 		 1356 aa  69.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  27.7 
 
 		 528 aa  69.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  27.38 
 
 		 658 aa  68.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  25.81 
 
 		 859 aa  68.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  29.71 
 
 		 679 aa  68.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  38.18 
 
 		 799 aa  67.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1315 aa  67.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  31.82 
 
 		 1300 aa  67.4  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  29.28 
 
 		 1094 aa  67  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  29.6 
 
 		 1120 aa  67  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  28.82 
 
 		 713 aa  65.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  27.79 
 
 		 685 aa  65.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  28.14 
 
 		 1969 aa  65.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  29.57 
 
 		 1882 aa  65.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  29.55 
 
 		 547 aa  66.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  31.87 
 
 		 941 aa  65.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  25.39 
 
 		 1602 aa  65.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  24.07 
 
 		 1162 aa  65.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  27.53 
 
 		 861 aa  64.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  31.92 
 
 		 2036 aa  64.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  33.18 
 
 		 675 aa  64.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  30.67 
 
 		 1361 aa  63.9  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  26.95 
 
 		 1296 aa  63.9  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  26.25 
 
 		 1474 aa  63.9  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  34.78 
 
 		 2554 aa  63.9  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  29.52 
 
 		 910 aa  63.9  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  25.47 
 
 		 2278 aa  63.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  31.09 
 
 		 1842 aa  63.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1804 aa  63.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  28.97 
 
 		 684 aa  63.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  25.27 
 
 		 575 aa  62.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  28.83 
 
 		 1528 aa  62.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  33.18 
 
 		 669 aa  62  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  27.06 
 
 		 2122 aa  62  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  28.85 
 
 		 791 aa  62  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  23.66 
 
 		 1607 aa  62  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  25.95 
 
 		 1002 aa  61.6  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  25.76 
 
 		 989 aa  61.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1106 aa  61.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  25 
 
 		 1068 aa  60.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  26.04 
 
 		 1585 aa  61.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  27.54 
 
 		 460 aa  60.8  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  26.18 
 
 		 958 aa  60.8  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  31.21 
 
 		 1980 aa  60.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  36.99 
 
 		 184 aa  60.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  26.05 
 
 		 551 aa  60.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1667 aa  60.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1969 aa  59.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  27.76 
 
 		 1414 aa  60.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  26.04 
 
 		 1217 aa  59.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  29.25 
 
 		 734 aa  60.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  31.53 
 
 		 581 aa  58.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  34.01 
 
 		 644 aa  59.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  29.44 
 
 		 441 aa  59.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0786  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.16 
 
 		 711 aa  59.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  33.33 
 
 		 1231 aa  58.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  26.2 
 
 		 1108 aa  58.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  28.77 
 
 		 838 aa  58.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  30.38 
 
 		 929 aa  58.2  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  30.83 
 
 		 918 aa  58.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  26.05 
 
 		 1247 aa  58.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.27 
 
 		 2031 aa  58.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  31.21 
 
 		 940 aa  57.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  28.03 
 
 		 930 aa  57.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  27.51 
 
 		 1466 aa  57.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  31.12 
 
 		 517 aa  57  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>