11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4326 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4326  hypothetical protein  100 
 
 
511 aa  1034    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3866  hypothetical protein  33.78 
 
 
535 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.991992  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4605  hypothetical protein  33.49 
 
 
571 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.723744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3849  Parallel beta-helix repeat protein  31.32 
 
 
526 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  28.47 
 
 
1771 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5860  hypothetical protein  24.53 
 
 
451 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  0.516752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3463  parallel beta-helix repeat protein  27.82 
 
 
465 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2487  parallel beta-helix repeat protein  23.65 
 
 
462 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.67625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2252  hypothetical protein  27.91 
 
 
695 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1970  hypothetical protein  28.95 
 
 
459 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.1118  hitchhiker  0.0000000245675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2615  hypothetical protein  21.51 
 
 
470 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.179343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>