61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0005 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 775 aa  1520    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  47.61 
 
 		 1216 aa  555  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  46.91 
 
 		 1170 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  34.88 
 
 		 743 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  32.22 
 
 		 799 aa  161  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  29.7 
 
 		 852 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  31.37 
 
 		 1332 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  31.76 
 
 		 2192 aa  118  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  33.06 
 
 		 1092 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  28.49 
 
 		 507 aa  106  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1010 aa  98.2  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1318 aa  91.3  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  27.47 
 
 		 1526 aa  85.5  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  25.05 
 
 		 441 aa  80.5  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  27.61 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1106 aa  75.1  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  25.91 
 
 		 1296 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  32.3 
 
 		 792 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  46.67 
 
 		 994 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1055 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0992  putative Vgr-related protein  23.81 
 
 		 979 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  44.55 
 
 		 14944 aa  58.9  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  32.84 
 
 		 1507 aa  57.8  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  31.75 
 
 		 1969 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.38 
 
 		 1383 aa  55.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.54 
 
 		 1657 aa  55.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  31.74 
 
 		 1288 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  27.95 
 
 		 637 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.22 
 
 		 2031 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1027  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1525 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.275206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  29.64 
 
 		 3793 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  29.54 
 
 		 794 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  28.24 
 
 		 799 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  30.77 
 
 		 464 aa  50.8  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  27.62 
 
 		 1483 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  43.04 
 
 		 826 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  39.6 
 
 		 540 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  27.46 
 
 		 5453 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  29.11 
 
 		 822 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.57 
 
 		 1607 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  25.99 
 
 		 797 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  29.96 
 
 		 2713 aa  48.9  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  30.65 
 
 		 1252 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.65 
 
 		 1234 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  30.65 
 
 		 1250 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  30.65 
 
 		 1234 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  30.65 
 
 		 1250 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.07 
 
 		 714 aa  48.5  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  36.67 
 
 		 1130 aa  48.5  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  27.91 
 
 		 417 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  29.08 
 
 		 2270 aa  47.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  28.46 
 
 		 1132 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  30.11 
 
 		 1234 aa  46.6  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  27.27 
 
 		 468 aa  46.2  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  24 
 
 		 601 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  30.13 
 
 		 951 aa  45.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  29.19 
 
 		 1755 aa  45.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1976 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.9 
 
 		 884 aa  45.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  31.76 
 
 		 945 aa  44.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  41.79 
 
 		 721 aa  45.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>