86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3647 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  890    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  68.4 
 
 		 468 aa  528  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  53.12 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  54.27 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  53.42 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  55.91 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  53.55 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  53.35 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  55.21 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  54.47 
 
 		 455 aa  385  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  55.7 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  51.69 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.46 
 
 		 479 aa  378  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  53.6 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  49.89 
 
 		 464 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  56.63 
 
 		 477 aa  363  4e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.61 
 
 		 464 aa  354  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  50.53 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  49.16 
 
 		 466 aa  353  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  50 
 
 		 465 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  51.89 
 
 		 462 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  51.43 
 
 		 557 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  50.33 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  50.94 
 
 		 461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  44.94 
 
 		 505 aa  342  9e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  52.45 
 
 		 432 aa  341  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  51.37 
 
 		 462 aa  336  5.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  51.32 
 
 		 496 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  49.17 
 
 		 460 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  50.1 
 
 		 493 aa  333  5e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  52.13 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.69 
 
 		 462 aa  326  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  51.67 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  52.08 
 
 		 473 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.79 
 
 		 478 aa  313  4.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  49.28 
 
 		 489 aa  312  7.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  47.87 
 
 		 476 aa  310  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  47.9 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  51.59 
 
 		 361 aa  303  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  49.45 
 
 		 441 aa  297  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  51.58 
 
 		 415 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  50.25 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  51.14 
 
 		 433 aa  293  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  51.17 
 
 		 446 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  48.57 
 
 		 435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  48.52 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  40.6 
 
 		 509 aa  193  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  38.61 
 
 		 476 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  37.73 
 
 		 483 aa  177  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  36.71 
 
 		 532 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  36.21 
 
 		 481 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  36.11 
 
 		 477 aa  166  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  35.13 
 
 		 523 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  31.89 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  33.41 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  34.56 
 
 		 501 aa  137  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  41.4 
 
 		 673 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  41.76 
 
 		 840 aa  98.2  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  48.75 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.25 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1318 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  42.61 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  27.65 
 
 		 767 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  30.45 
 
 		 2160 aa  56.6  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  29.49 
 
 		 1296 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  27.69 
 
 		 575 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  29.9 
 
 		 601 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  26.72 
 
 		 593 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  25.88 
 
 		 863 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  27.96 
 
 		 852 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  34.53 
 
 		 294 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  25.83 
 
 		 1092 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  31.54 
 
 		 523 aa  50.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  30.77 
 
 		 775 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1010 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  27.07 
 
 		 558 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  27.6 
 
 		 799 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  30 
 
 		 2192 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  27.54 
 
 		 759 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.77 
 
 		 530 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  25.19 
 
 		 527 aa  47.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  28.09 
 
 		 591 aa  47  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  41.77 
 
 		 717 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  26.59 
 
 		 743 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  31.7 
 
 		 412 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  27.84 
 
 		 575 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>