88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3668 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  981    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  46.96 
 
 		 509 aa  336  5.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  47.63 
 
 		 476 aa  332  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  48.79 
 
 		 481 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  45.25 
 
 		 483 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  47.32 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.67 
 
 		 465 aa  229  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.07 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  41.44 
 
 		 462 aa  223  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  40.12 
 
 		 464 aa  221  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  41.18 
 
 		 450 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  41.5 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  39.6 
 
 		 459 aa  213  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  40.14 
 
 		 465 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  38.05 
 
 		 461 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  42.82 
 
 		 457 aa  204  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  38.77 
 
 		 454 aa  204  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  39.23 
 
 		 466 aa  202  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  43.54 
 
 		 467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  41.34 
 
 		 361 aa  196  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  42.13 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  38.86 
 
 		 468 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  40.16 
 
 		 446 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  39.07 
 
 		 454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  39.39 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.62 
 
 		 462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  38.92 
 
 		 461 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  38.1 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.24 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  37.63 
 
 		 455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  34.04 
 
 		 477 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  35.89 
 
 		 464 aa  179  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  39.85 
 
 		 439 aa  179  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  43.04 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  39.12 
 
 		 493 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  36.62 
 
 		 459 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  39.49 
 
 		 557 aa  176  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  41.61 
 
 		 473 aa  176  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  40.53 
 
 		 464 aa  176  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  40.36 
 
 		 415 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  38.05 
 
 		 489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  33.92 
 
 		 523 aa  173  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.36 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  38 
 
 		 457 aa  170  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  39.51 
 
 		 435 aa  170  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  39.3 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  37.8 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  35.83 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  32.86 
 
 		 483 aa  167  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  36.28 
 
 		 505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  37.4 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  37.11 
 
 		 476 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  39.1 
 
 		 496 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  34.68 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  33.65 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  39.8 
 
 		 673 aa  94  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  29.87 
 
 		 840 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  29.77 
 
 		 541 aa  80.9  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  30.8 
 
 		 759 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  29.81 
 
 		 767 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  34.78 
 
 		 1755 aa  64.3  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  31.05 
 
 		 530 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  27.78 
 
 		 1296 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  37.38 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  28.96 
 
 		 2160 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  33.16 
 
 		 523 aa  55.1  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.57 
 
 		 884 aa  53.5  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  30.51 
 
 		 717 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  29.39 
 
 		 572 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  28.57 
 
 		 852 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  28.48 
 
 		 575 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  26.92 
 
 		 863 aa  50.4  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  31.09 
 
 		 1037 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  26.01 
 
 		 575 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  27.02 
 
 		 593 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  28.57 
 
 		 1092 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  25.87 
 
 		 518 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  32.18 
 
 		 987 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  26.99 
 
 		 591 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1318 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  27.82 
 
 		 659 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  31.33 
 
 		 1359 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  35.78 
 
 		 168 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.26 
 
 		 1800 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3328  polymorphic outer membrane protein  35.63 
 
 		 272 aa  43.5  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000184033 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1106 aa  43.1  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>