66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3060 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  100 
 
 		 673 aa  1329    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  74.3 
 
 		 840 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  44.1 
 
 		 523 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  44.64 
 
 		 532 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.05 
 
 		 465 aa  135  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  37.11 
 
 		 454 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  37.46 
 
 		 466 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  34.97 
 
 		 462 aa  127  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.21 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  35.77 
 
 		 465 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  34.16 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  36.79 
 
 		 509 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  35.94 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  36.05 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  36.49 
 
 		 464 aa  112  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  33.44 
 
 		 459 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  31.1 
 
 		 464 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  35.94 
 
 		 454 aa  110  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.86 
 
 		 462 aa  108  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  34.27 
 
 		 459 aa  108  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  35.52 
 
 		 450 aa  107  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  33.93 
 
 		 361 aa  107  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  33.33 
 
 		 481 aa  107  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  35.17 
 
 		 468 aa  105  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  34.35 
 
 		 483 aa  103  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  36.27 
 
 		 462 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  33.45 
 
 		 493 aa  101  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  32.32 
 
 		 501 aa  100  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  42.05 
 
 		 473 aa  100  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  35.13 
 
 		 455 aa  100  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  33.33 
 
 		 477 aa  100  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  34.86 
 
 		 466 aa  100  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  37.4 
 
 		 476 aa  99.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  37.33 
 
 		 435 aa  99.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 435 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  33.94 
 
 		 483 aa  98.6  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  39.49 
 
 		 461 aa  98.2  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.51 
 
 		 464 aa  97.8  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  32.25 
 
 		 457 aa  97.1  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  37.88 
 
 		 464 aa  95.5  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  34.98 
 
 		 505 aa  95.5  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  35.92 
 
 		 457 aa  94.4  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  33.92 
 
 		 467 aa  93.6  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  48.67 
 
 		 441 aa  92.8  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  35.38 
 
 		 489 aa  93.2  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  36.36 
 
 		 476 aa  92.8  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.09 
 
 		 478 aa  92  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  40.22 
 
 		 461 aa  91.3  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  35.27 
 
 		 433 aa  89.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  39.73 
 
 		 477 aa  89.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  37.63 
 
 		 477 aa  88.2  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  52.58 
 
 		 452 aa  87.8  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  49.09 
 
 		 415 aa  87  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  34.17 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  31.62 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  33.09 
 
 		 557 aa  77.4  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  46.81 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  34.81 
 
 		 448 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.84 
 
 		 530 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  26.86 
 
 		 1296 aa  51.2  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  36.59 
 
 		 362 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  32.24 
 
 		 523 aa  46.6  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  30.92 
 
 		 2160 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  26.43 
 
 		 863 aa  44.7  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  26.67 
 
 		 558 aa  44.3  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  37.36 
 
 		 294 aa  44.3  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>