81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3011 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  100 
 
 		 466 aa  904    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  78.06 
 
 		 505 aa  727    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  53.52 
 
 		 454 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  55.88 
 
 		 467 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.78 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  51.75 
 
 		 465 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.5 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  49.68 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  51.05 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  50.42 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  51.66 
 
 		 489 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  50.64 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  52.01 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  50.64 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  52.75 
 
 		 455 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  47.99 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.85 
 
 		 479 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  51.14 
 
 		 462 aa  362  6e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  49.68 
 
 		 464 aa  361  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  52.64 
 
 		 457 aa  359  6e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  51.67 
 
 		 464 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  52.04 
 
 		 435 aa  353  5e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  49.28 
 
 		 468 aa  351  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  49.79 
 
 		 452 aa  350  4e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  48.21 
 
 		 493 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  48.42 
 
 		 464 aa  345  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  54.64 
 
 		 361 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  50.74 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  52.16 
 
 		 496 aa  340  5e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  51.86 
 
 		 557 aa  336  7e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  47.87 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  53.03 
 
 		 435 aa  333  5e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  47.2 
 
 		 477 aa  332  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  50.79 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  48.76 
 
 		 478 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  51.96 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  47.8 
 
 		 462 aa  323  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  48.64 
 
 		 462 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  54.97 
 
 		 415 aa  318  9e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  47.52 
 
 		 476 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  48.21 
 
 		 439 aa  302  9e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  47.42 
 
 		 446 aa  299  9e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  45.4 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  43.93 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  45.67 
 
 		 448 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  45.58 
 
 		 433 aa  277  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  36.7 
 
 		 481 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  38.12 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  36.55 
 
 		 483 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  34.22 
 
 		 523 aa  170  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  37.21 
 
 		 476 aa  169  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  36.54 
 
 		 532 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  35.87 
 
 		 477 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  36.85 
 
 		 501 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  33.82 
 
 		 483 aa  140  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  32.95 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  39.89 
 
 		 840 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  33.8 
 
 		 673 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  43.36 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  31.1 
 
 		 2160 aa  67.8  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  34.52 
 
 		 541 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  29.34 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  30.25 
 
 		 759 aa  60.1  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  38.41 
 
 		 717 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  28.16 
 
 		 593 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  26.55 
 
 		 575 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  26.26 
 
 		 530 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  29.95 
 
 		 1296 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.25 
 
 		 884 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  27.59 
 
 		 575 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  33.62 
 
 		 362 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  41.67 
 
 		 294 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  34.72 
 
 		 1037 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  26.5 
 
 		 767 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  25.2 
 
 		 863 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54658  predicted protein  37.8 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000768502  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  31.97 
 
 		 350 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  24.39 
 
 		 527 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1106 aa  44.3  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  33.1 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 		 913 aa  43.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>