70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3286 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  100 
 
 		 840 aa  1632    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  79.18 
 
 		 673 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  44.79 
 
 		 523 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  41.19 
 
 		 532 aa  182  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  39.07 
 
 		 466 aa  134  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  37.46 
 
 		 454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.41 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  35.04 
 
 		 462 aa  122  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  36.2 
 
 		 454 aa  121  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.73 
 
 		 465 aa  115  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.79 
 
 		 462 aa  112  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  35.94 
 
 		 460 aa  112  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  35.92 
 
 		 459 aa  112  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  35.13 
 
 		 454 aa  111  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  35.04 
 
 		 465 aa  109  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  33.94 
 
 		 457 aa  110  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  34.42 
 
 		 450 aa  109  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  33.22 
 
 		 464 aa  108  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  34.74 
 
 		 468 aa  107  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  35.56 
 
 		 439 aa  107  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  32.75 
 
 		 459 aa  107  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  34.27 
 
 		 464 aa  106  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  31.08 
 
 		 501 aa  103  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  33.81 
 
 		 361 aa  102  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  34.39 
 
 		 467 aa  102  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  32.85 
 
 		 493 aa  102  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  34.81 
 
 		 477 aa  100  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  32.44 
 
 		 509 aa  100  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  31.21 
 
 		 481 aa  99.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  37.44 
 
 		 483 aa  100  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  37.67 
 
 		 435 aa  98.6  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  34.53 
 
 		 505 aa  98.2  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  38.62 
 
 		 433 aa  98.2  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  39.89 
 
 		 462 aa  95.9  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  35.49 
 
 		 483 aa  95.5  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  32.75 
 
 		 466 aa  95.5  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  41.67 
 
 		 457 aa  94.7  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  42.13 
 
 		 461 aa  94.7  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  55.1 
 
 		 452 aa  93.6  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  54.37 
 
 		 461 aa  94  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  33.09 
 
 		 446 aa  93.2  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  35.02 
 
 		 489 aa  92  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  45.74 
 
 		 435 aa  91.3  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  51.38 
 
 		 415 aa  91.3  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.44 
 
 		 464 aa  91.3  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  35.61 
 
 		 557 aa  90.9  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  50.46 
 
 		 441 aa  90.1  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  45.32 
 
 		 478 aa  89  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  39.89 
 
 		 455 aa  89  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  40.53 
 
 		 464 aa  88.6  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  47.27 
 
 		 476 aa  88.2  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  36.95 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  39.57 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  42.15 
 
 		 477 aa  84.3  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  51.04 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  50.57 
 
 		 477 aa  83.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  51.06 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  38.86 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1977 aa  65.1  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3121  mucin 17-like protein  31.84 
 
 		 1788 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  32.98 
 
 		 750 aa  58.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  25.57 
 
 		 1296 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  23.77 
 
 		 1131 aa  57  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  26.43 
 
 		 863 aa  50.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  30.2 
 
 		 523 aa  47.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  32.09 
 
 		 294 aa  47.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.47 
 
 		 530 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  30.38 
 
 		 2192 aa  46.2  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  44.83 
 
 		 248 aa  45.8  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  29.3 
 
 		 1332 aa  45.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>