76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4912 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 446 aa  863    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  56.01 
 
 		 459 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  55.72 
 
 		 454 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  56.87 
 
 		 465 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  57.05 
 
 		 467 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  59 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  54.13 
 
 		 464 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  57.27 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  58.7 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  52.38 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  56.59 
 
 		 455 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  54.98 
 
 		 452 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  53.63 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  55.72 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  56.46 
 
 		 464 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  55.33 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  53.98 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  54.58 
 
 		 479 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  55.56 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  54.79 
 
 		 557 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  52.42 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  55.48 
 
 		 468 aa  365  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  53.53 
 
 		 489 aa  360  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  51.61 
 
 		 459 aa  359  7e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  56.48 
 
 		 457 aa  358  8e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  53.91 
 
 		 462 aa  352  8.999999999999999e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  52.98 
 
 		 476 aa  352  8.999999999999999e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  50.96 
 
 		 461 aa  343  5e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  51.75 
 
 		 432 aa  342  7e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  45.65 
 
 		 505 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  52.13 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  54.18 
 
 		 496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  51.52 
 
 		 457 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  48.39 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  48.1 
 
 		 493 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  54.84 
 
 		 361 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  52.82 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  50.73 
 
 		 478 aa  317  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  51.88 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  51.84 
 
 		 448 aa  299  6e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  46.67 
 
 		 439 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  50.69 
 
 		 433 aa  296  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  54.5 
 
 		 415 aa  296  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  48.93 
 
 		 466 aa  295  8e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  48.55 
 
 		 477 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  45.83 
 
 		 473 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  37.22 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  41.59 
 
 		 476 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  37.63 
 
 		 483 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  40 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  41.67 
 
 		 501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  36.2 
 
 		 523 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  38.06 
 
 		 477 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  35.76 
 
 		 532 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  33.89 
 
 		 477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  31.25 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  50.42 
 
 		 840 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  49.04 
 
 		 673 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  42.37 
 
 		 168 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  29.72 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  29.68 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  33.8 
 
 		 2160 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  26.18 
 
 		 530 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  35.2 
 
 		 2192 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1106 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1023 aa  50.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  28.51 
 
 		 759 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  27.16 
 
 		 767 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  26.07 
 
 		 527 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  35.65 
 
 		 1037 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  25.89 
 
 		 591 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.62 
 
 		 884 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  33.12 
 
 		 1296 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  41.38 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  33.92 
 
 		 572 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  29.02 
 
 		 516 aa  43.1  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>