71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0383 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  959    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  54.95 
 
 
454 aa  488  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  66.3 
 
 
361 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  56.77 
 
 
465 aa  451  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  56.16 
 
 
455 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  56.85 
 
 
457 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  55.56 
 
 
464 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  54.44 
 
 
464 aa  422  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  49.4 
 
 
454 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  50.49 
 
 
465 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  52.51 
 
 
459 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  54.33 
 
 
479 aa  392  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  52.39 
 
 
462 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  57.14 
 
 
435 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  51.62 
 
 
450 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  49.2 
 
 
464 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  50.71 
 
 
460 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  50.49 
 
 
467 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  48.01 
 
 
452 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  48.48 
 
 
454 aa  363  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  51.38 
 
 
468 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  50.4 
 
 
557 aa  355  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  49.2 
 
 
461 aa  353  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  48 
 
 
466 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  46.95 
 
 
462 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  45.81 
 
 
505 aa  347  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  48.52 
 
 
489 aa  347  4e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  48 
 
 
459 aa  342  7e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  53.68 
 
 
435 aa  341  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  54.35 
 
 
441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  50.5 
 
 
464 aa  333  5e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  49.42 
 
 
477 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  49.8 
 
 
457 aa  332  9e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  49.8 
 
 
462 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  47.96 
 
 
496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  47.94 
 
 
476 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  44.27 
 
 
461 aa  313  6.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.12 
 
 
478 aa  309  6.999999999999999e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  49.79 
 
 
473 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  52.71 
 
 
415 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  46.29 
 
 
446 aa  293  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  44 
 
 
432 aa  292  9e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  46.78 
 
 
433 aa  287  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  50 
 
 
439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  47.23 
 
 
466 aa  276  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  44.11 
 
 
448 aa  262  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  37.05 
 
 
481 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  39.75 
 
 
483 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  37.39 
 
 
476 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  34.74 
 
 
532 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  35.58 
 
 
509 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  36.32 
 
 
523 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  39.35 
 
 
501 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  36.24 
 
 
477 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  30.88 
 
 
477 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  30.48 
 
 
483 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  36.62 
 
 
673 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  46.67 
 
 
840 aa  94.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  48.21 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  30.98 
 
 
863 aa  63.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  29.86 
 
 
572 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  31.58 
 
 
523 aa  55.1  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  32.1 
 
 
767 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  29.54 
 
 
530 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  28.35 
 
 
759 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  27.85 
 
 
601 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  28.57 
 
 
1296 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  30.37 
 
 
717 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  37.96 
 
 
1037 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  33.7 
 
 
558 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  38.1 
 
 
362 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>