111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2401 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 362 aa  669    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  50.43 
 
 		 412 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  54.74 
 
 		 717 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  35.49 
 
 		 558 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1106 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  34.77 
 
 		 852 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  30.79 
 
 		 591 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  31.11 
 
 		 575 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  30.47 
 
 		 593 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  30.75 
 
 		 518 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  30.33 
 
 		 541 aa  93.6  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  36.7 
 
 		 465 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  35.06 
 
 		 459 aa  89.7  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  31.62 
 
 		 665 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  39.73 
 
 		 462 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  32.87 
 
 		 767 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  32.63 
 
 		 530 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  29.14 
 
 		 593 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  30.41 
 
 		 1061 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  32.46 
 
 		 2192 aa  87  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  35.27 
 
 		 527 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  30.07 
 
 		 575 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  29.71 
 
 		 659 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  28.82 
 
 		 591 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.49 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  36.36 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  29.17 
 
 		 601 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  37.22 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  32.84 
 
 		 759 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  37.12 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.38 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  34.02 
 
 		 2042 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  35.29 
 
 		 2160 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  36.41 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  35.94 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.01 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  35.18 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  36.57 
 
 		 505 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  31.51 
 
 		 464 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  33.78 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  33.05 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  31.88 
 
 		 546 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  33.05 
 
 		 526 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  34.21 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  35.43 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  34.6 
 
 		 509 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  34.98 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  36.99 
 
 		 466 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  38.95 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  32.79 
 
 		 545 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  34.85 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  29.9 
 
 		 655 aa  69.7  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  34.21 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  41.78 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  32.61 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  35.71 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  34.95 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.05 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  36.56 
 
 		 454 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  29.46 
 
 		 516 aa  67.4  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  34.63 
 
 		 457 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  34.58 
 
 		 464 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  33.6 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 647 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1318 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  33.98 
 
 		 1037 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  32.44 
 
 		 523 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  33.8 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  30.49 
 
 		 1296 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  36.7 
 
 		 523 aa  62.8  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  26.96 
 
 		 913 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  29.87 
 
 		 572 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  34.91 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1010 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.12 
 
 		 1800 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  27.84 
 
 		 3066 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  30.97 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  38.43 
 
 		 415 aa  59.3  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  31.9 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  31.79 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  31.43 
 
 		 432 aa  57  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  32.39 
 
 		 452 aa  57  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  33.18 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  31.56 
 
 		 532 aa  56.6  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  36.44 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  31.16 
 
 		 1755 aa  56.2  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1023 aa  56.2  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  34.44 
 
 		 477 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  33.62 
 
 		 464 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.52 
 
 		 884 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  29.4 
 
 		 799 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  34.78 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  35.14 
 
 		 476 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  32.12 
 
 		 731 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  28.8 
 
 		 743 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  34.18 
 
 		 476 aa  49.7  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  35.66 
 
 		 673 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  29.62 
 
 		 1332 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  28.03 
 
 		 786 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  30.17 
 
 		 496 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>