38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3191 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  100 
 
 
593 aa  1197    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  45.08 
 
 
601 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  28.27 
 
 
593 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  27.18 
 
 
575 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  33.58 
 
 
545 aa  84.7  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  31.59 
 
 
591 aa  83.6  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  36.2 
 
 
546 aa  77  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  30.41 
 
 
1106 aa  75.5  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  26.37 
 
 
575 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  29.18 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  30.68 
 
 
1061 aa  70.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.74 
 
 
541 aa  70.5  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  31.43 
 
 
647 aa  67.4  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  27.17 
 
 
913 aa  63.9  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  29.12 
 
 
759 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  28.35 
 
 
2192 aa  62  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  30.09 
 
 
717 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  35.21 
 
 
362 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  30.6 
 
 
591 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  29.41 
 
 
2042 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  26.95 
 
 
731 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  24.52 
 
 
655 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  25.29 
 
 
518 aa  57.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  31.33 
 
 
527 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  27.7 
 
 
767 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  33.95 
 
 
786 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  30.06 
 
 
2160 aa  52  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  25.35 
 
 
659 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  29.61 
 
 
1010 aa  50.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.85 
 
 
1800 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  27.56 
 
 
483 aa  47.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  30.41 
 
 
462 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  26.15 
 
 
464 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  28.64 
 
 
466 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  24.55 
 
 
467 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  33.59 
 
 
817 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  24.62 
 
 
439 aa  43.9  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  23.58 
 
 
665 aa  43.5  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>