106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2841 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  73.39 
 
 		 767 aa  1092    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 759 aa  1506    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  44.58 
 
 		 2890 aa  140  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  46.01 
 
 		 2876 aa  138  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  46.25 
 
 		 2112 aa  114  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  31.87 
 
 		 2192 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  34.09 
 
 		 2042 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  33.71 
 
 		 483 aa  98.6  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  32.39 
 
 		 665 aa  97.4  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  31.87 
 
 		 659 aa  94  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  29.01 
 
 		 1061 aa  90.9  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  41.27 
 
 		 786 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  28.82 
 
 		 545 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  34.75 
 
 		 477 aa  84.3  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  34.12 
 
 		 465 aa  84  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  30 
 
 		 481 aa  83.2  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  29.07 
 
 		 591 aa  83.2  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  29.98 
 
 		 913 aa  81.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  27.78 
 
 		 591 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  31.72 
 
 		 575 aa  78.2  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  27.95 
 
 		 1037 aa  77.4  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  27.68 
 
 		 518 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  30.22 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  28.84 
 
 		 546 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  27.79 
 
 		 655 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  31.91 
 
 		 647 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1315 aa  71.2  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  28.4 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  33.75 
 
 		 461 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  36.73 
 
 		 575 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  27.4 
 
 		 476 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  41.22 
 
 		 817 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  28.91 
 
 		 459 aa  70.1  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  31.15 
 
 		 468 aa  69.7  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  31.01 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  28.91 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  31.3 
 
 		 593 aa  67.8  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  29.64 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.61 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  28.07 
 
 		 477 aa  67.4  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  30.45 
 
 		 452 aa  67  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  32.67 
 
 		 3394 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  30.54 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  31.23 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  31.38 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  30.18 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  31.08 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  32.11 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  30.53 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  29.86 
 
 		 593 aa  62  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  31.77 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  29.63 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.13 
 
 		 465 aa  60.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  37.8 
 
 		 2690 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  28.38 
 
 		 505 aa  60.1  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  29.13 
 
 		 601 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  33.33 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.4 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  27.65 
 
 		 2160 aa  57.4  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  26.19 
 
 		 523 aa  57  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3285  Outer membrane autotransporter barrel  56.14 
 
 		 1895 aa  56.6  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.761058 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  31.16 
 
 		 1197 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  30.91 
 
 		 731 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.8 
 
 		 479 aa  55.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  24.53 
 
 		 483 aa  55.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  48.39 
 
 		 870 aa  55.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  29.24 
 
 		 460 aa  55.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  26.6 
 
 		 433 aa  55.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  34.09 
 
 		 852 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.58 
 
 		 1800 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  27.91 
 
 		 464 aa  54.7  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  31.4 
 
 		 462 aa  54.7  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  30.42 
 
 		 435 aa  54.3  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  33.52 
 
 		 541 aa  54.3  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0693  polymorphic membrane protein A family protein  31.9 
 
 		 986 aa  54.3  0.000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  30.42 
 
 		 457 aa  54.3  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  31.74 
 
 		 717 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  25.94 
 
 		 572 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  30.29 
 
 		 526 aa  52.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  27.2 
 
 		 496 aa  52  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  26.97 
 
 		 439 aa  52  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1318 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  24.04 
 
 		 501 aa  51.6  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  30.83 
 
 		 489 aa  51.6  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  31.09 
 
 		 432 aa  51.2  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1106 aa  51.2  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  32.91 
 
 		 1234 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  29.84 
 
 		 415 aa  50.8  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1010 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  29.84 
 
 		 557 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  39.29 
 
 		 362 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  27.17 
 
 		 462 aa  48.9  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  29.13 
 
 		 558 aa  48.1  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  42.17 
 
 		 2886 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  28.06 
 
 		 2528 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 497 aa  46.6  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  36.73 
 
 		 1626 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  27.08 
 
 		 446 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  29.79 
 
 		 150 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.48 
 
 		 1234 aa  44.7  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>