32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4915 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  59.23 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  44.19 
 
 		 130 aa  113  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  52.69 
 
 		 138 aa  106  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  43.41 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  44.44 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  45.45 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  40.32 
 
 		 140 aa  94.4  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  38.17 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  46.07 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  41.84 
 
 		 158 aa  87.4  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  39.39 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  40.82 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  45 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  37.74 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  33.59 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  37.84 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  37.5 
 
 		 270 aa  81.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  40.46 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  36.67 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  37 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  37.14 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  34.34 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  39.47 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  36.19 
 
 		 231 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  29.66 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  38.1 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  32 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2468  protein of unknown function DUF1573  34.21 
 
 		 347 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  31.07 
 
 		 759 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2267  hypothetical protein  32.5 
 
 		 268 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2435  protein of unknown function DUF1573  28.75 
 
 		 383 aa  41.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>