31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2981 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  265  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  39.23 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  43 
 
 
161 aa  90.1  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  42.86 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  33.59 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  36.09 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  47.67 
 
 
147 aa  77  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  37.07 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  43.33 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  37.37 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  35 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  67  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  37.1 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  33.33 
 
 
362 aa  60.5  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  31.71 
 
 
131 aa  60.1  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  29.51 
 
 
388 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  30.51 
 
 
231 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  37.61 
 
 
229 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  34.51 
 
 
270 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  31.69 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0191  hypothetical protein  38.46 
 
 
220 aa  55.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.869571  normal  0.745181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2267  hypothetical protein  34.62 
 
 
268 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  33.03 
 
 
229 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  34.38 
 
 
240 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  29.57 
 
 
231 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  32.52 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  34.69 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  40.3 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  30.39 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2468  protein of unknown function DUF1573  30.3 
 
 
347 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>