33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0372 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  100 
 
 
122 aa  250  6e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  56.56 
 
 
140 aa  140  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  47.1 
 
 
145 aa  123  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  45.45 
 
 
150 aa  100  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  42.34 
 
 
130 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  47.13 
 
 
158 aa  89  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  37.59 
 
 
133 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  44.35 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  35.25 
 
 
131 aa  86.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  45.31 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  38.76 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  41 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  40.86 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  33.56 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  43.33 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  40.38 
 
 
362 aa  77  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  40.66 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  36.36 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  35 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  36.89 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  30.65 
 
 
229 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  39.13 
 
 
240 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  32.79 
 
 
229 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  31 
 
 
231 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  29.2 
 
 
231 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  29.29 
 
 
388 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2468  protein of unknown function DUF1573  34.85 
 
 
347 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6643  hypothetical protein  26.98 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2267  hypothetical protein  30.3 
 
 
268 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3670  protein of unknown function DUF1573  27.27 
 
 
369 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3648  hypothetical protein  30.69 
 
 
285 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.923752  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>