36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2713 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  455  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  62.17 
 
 		 231 aa  291  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  53.67 
 
 		 229 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  43.72 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  42.86 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  38.05 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  42.16 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  40.4 
 
 		 155 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  31.3 
 
 		 362 aa  72  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  35.85 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  32.48 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  38.27 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  32.03 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2435  protein of unknown function DUF1573  27.21 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  34.88 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  25.91 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  34.83 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  32.79 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  36.36 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  33.33 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  35.63 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  29.09 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  33.66 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  35.29 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  32.11 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  33.03 
 
 		 130 aa  52.4  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  31.03 
 
 		 131 aa  52  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3670  protein of unknown function DUF1573  23.48 
 
 		 369 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6267  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.82 
 
 		 658 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  27.78 
 
 		 1626 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3060  hypothetical protein  25.16 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.068223 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1802 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  34.55 
 
 		 138 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0191  hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.869571  normal  0.745181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  29.67 
 
 		 2690 aa  42.4  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0183  hypothetical protein  31.17 
 
 		 519 aa  42  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>