33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07901 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  56.56 
 
 
122 aa  140  8e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  46.04 
 
 
145 aa  114  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2277  hypothetical protein  51.54 
 
 
138 aa  103  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  40.32 
 
 
150 aa  94.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  46.09 
 
 
142 aa  92  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  40.29 
 
 
155 aa  90.1  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  39.2 
 
 
231 aa  87  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  40.94 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  35.77 
 
 
131 aa  83.6  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  42.86 
 
 
130 aa  82  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  39.82 
 
 
240 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  40.7 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  43.93 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  33.08 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  39.42 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  34.58 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  37.84 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  35.09 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  37.5 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  31.75 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  32.48 
 
 
229 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  29.33 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  37.37 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  30.65 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  29.27 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  35.71 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  30.39 
 
 
388 aa  60.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2468  protein of unknown function DUF1573  27.14 
 
 
347 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0191  hypothetical protein  31.82 
 
 
220 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.869571  normal  0.745181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6643  hypothetical protein  25.21 
 
 
128 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  25.51 
 
 
759 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2267  hypothetical protein  31.25 
 
 
268 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal  0.508786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>