38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3399 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1031  hypothetical protein  53.67 
 
 
231 aa  245  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000197083  hitchhiker  0.000134456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  53.67 
 
 
229 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2498  protein of unknown function DUF1573  46.79 
 
 
231 aa  210  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1750  protein of unknown function DUF1573  45.87 
 
 
231 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000472104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2548  hypothetical protein  38.05 
 
 
240 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059239  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  39.25 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2435  protein of unknown function DUF1573  31.58 
 
 
383 aa  75.5  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2663  hypothetical protein  36.28 
 
 
131 aa  74.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.792509  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1993  hypothetical protein  27.51 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07901  hypothetical protein  31.75 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1402  protein of unknown function DUF1573  36.27 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0153707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2444  hypothetical protein  34.04 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199257  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4926  protein of unknown function DUF1573  39.39 
 
 
155 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816927  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_002950  PG0319  hypothetical protein  36.75 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6328  protein of unknown function DUF1573  35.63 
 
 
150 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0372  protein of unknown function DUF1573  30.65 
 
 
122 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1003  hypothetical protein  30 
 
 
388 aa  63.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.315235  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3633  protein of unknown function DUF1573  34.17 
 
 
131 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4915  protein of unknown function DUF1573  32 
 
 
150 aa  61.6  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143634  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4968  hypothetical protein  34.31 
 
 
138 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107431  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3670  protein of unknown function DUF1573  26.39 
 
 
369 aa  59.7  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0191  hypothetical protein  29.91 
 
 
220 aa  58.5  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.869571  normal  0.745181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6248  protein of unknown function DUF1573  34.88 
 
 
147 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2981  hypothetical protein  37.61 
 
 
130 aa  58.5  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  23.32 
 
 
607 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12918  hypothetical protein  34.88 
 
 
158 aa  55.5  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25736  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1508  protein of unknown function DUF1573  33.65 
 
 
130 aa  55.5  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.186787  normal  0.452897 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1722  hypothetical protein  30.3 
 
 
145 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667062  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1264  protein of unknown function DUF1573  32.04 
 
 
133 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132207  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2468  protein of unknown function DUF1573  31.37 
 
 
347 aa  48.9  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1647  protein of unknown function DUF1573  30.77 
 
 
130 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3648  hypothetical protein  31.17 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.923752  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  28.15 
 
 
1029 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  27.41 
 
 
1192 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6267  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 
658 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  27.45 
 
 
1626 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3061  hypothetical protein  39.22 
 
 
85 aa  42  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.060497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>